标签: jupyter

典型地，一个运行jupyter notebook或jupyter-notebook或ipython notebook在终端局部地启动一个Jupyter笔记本网络服务器（和打开的浏览器中的URL）。使用conda 和conda 环境时，运行允许导入安装在 conda 环境中的 Python 模块的 Jupyter notebook 的最佳方法是什么？

因为它似乎，这 是 不是 很 直 向前 并 不少 用户 都有 类似的 烦恼。

最常见的错误信息似乎是：在康达环境中安装包后，XYZ my-env一个可以运行import XYZ在开始一个python控制台my-env中，但在运行相同的代码Jupyter笔记本将导致一个ImportError。

这个问题已经问过很多次了，但是没有很好的地方来回答它，大多数问答和Github门票都很混乱，所以让我们在这里开始新的问答。

我想在Jupyter笔记本中执行一个长期运行的Python脚本,这样我就可以破解中期生成的数据结构.

该脚本具有许多依赖项和命令行参数,并使用特定的virtualenv执行.是否可以从指定的virtualenv(与Jupyter安装的不同)交互式地在笔记本中运行Python脚本？

谢谢!

我一直在使用这篇文章中描述的方法来设置IPython笔记本,以便与Django很好地配合.该方法的要点是创建一个IPython扩展,它设置DJANGO_SETTINGS_MODULE并在IPython启动时运行django.setup().

扩展的代码是:

def load_ipython_extension(ipython):
    # The `ipython` argument is the currently active `InteractiveShell`
    # instance, which can be used in any way. This allows you to register
    # new magics or aliases, for example.
    try:
        import os
        os.environ.setdefault("DJANGO_SETTINGS_MODULE", "settings")
        import django
        django.setup()
    except ImportError:
        pass

随着最近升级到Jupyter笔记本电脑,这个设置现在已经打破了.我可以通过在笔记本的第一个单元格中添加类似的代码来在Jupyter笔记本中运行Django代码.但是,我无法弄清楚如何让Jupyter自动运行扩展程序,因此我不必为我正在创建的每个笔记本再次执行此操作.

我该怎么办才能让Django和Jupyter玩得很好？

更新: 对于@DarkLight - 我使用Django 1.8.5与Jupyter 1.0.0.我在笔记本中运行的代码是:

import os, sys
sys.path.insert(0, '/path/to/project')
os.environ.setdefault("DJANGO_SETTINGS_MODULE", "settingsfile")
import django
django.setup()

我正在使用firefox的jupyter(或Ipython)笔记本,并希望在单元格中调试一些python代码.我正在使用'import ipdb; ipdb.set_trace()'作为一种断点,例如我的单元格具有以下代码:

a=4
import ipdb; ipdb.set_trace()
b=5
print a
print b

用Shift + Enter执行后给出了这个错误:

--------------------------------------------------------------------------
MultipleInstanceError                     Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-f2b356251c56> in <module>()
      1 a=4
----> 2 import ipdb; ipdb.set_trace()
      3 b=5
      4 print a
      5 print b

/home/nnn/anaconda/lib/python2.7/site-packages/ipdb/__init__.py in <module>()
     14 # You should have received a copy of the GNU General Public License along with this program. If not, see http://www.gnu.org/licenses/.
     15 
---> 16 from ipdb.__main__ import set_trace, post_mortem, pm, run, runcall, runeval, launch_ipdb_on_exception
     17 
     18 …

我在使用Python 3.4.2 的Jupyter Notebook服务器(v4.2.2)上,我想使用全局名称__file__,因为笔记本将从其他用户克隆,并且我必须运行一个部分:

def __init__(self, trainingSamplesFolder='samples', maskFolder='masks'):
    self.trainingSamplesFolder = self.__getAbsPath(trainingSamplesFolder)
    self.maskFolder = self.__getAbsPath(maskFolder)

def __getAbsPath(self, path):
    if os.path.isabs(path):
        return path
    else:
        return os.path.join(os.path.dirname(__file__), path)

的__getAbsPath(self, path)检查是否一个path参数是相对或绝对路径和返回的绝对版本path.所以我可以path稍后安全地使用.

但是我得到了错误

NameError:'__file__'未定义名称

我在网上搜索了这个错误并找到了我应该更好地使用的"解决方案" sys.argv[0],但是print(sys.argv[0])返回了

/usr/local/lib/python3.4/dist-packages/ipykernel/__main__.py

但正确的笔记本位置应该是/home/ubuntu/notebooks/.

感谢您的参考如何从Martijn Pieters 获取当前的IPython Notebook名称(评论),最后的答案(不接受)非常适合我的需求:

print(os.getcwd())

/家庭/ Ubuntu的电脑/笔记本电脑

有没有办法在Jupyter笔记本上使用pipenv？

或者更具体地说,使用原子nteract /氢python 3内核？

我正在使用 jupyter 笔记本并安装。

ipywidgets==7.4.2 widgetsnbextension pandas-profiling=='.0.0

我也跑了：

!jupyter nbextension enable --py widgetsnbextension

但运行时：

from pandas_profiling import ProfileReport
profile = ProfileReport(df, title="Pandas Profiling Report", explorative=True)
profile.to_widgets()

我收到错误：

ImportError: IProgress not found. Please update jupyter and ipywidgets. See https://ipywidgets.readthedocs.io/en/stable/user_install.html

知道为什么吗？尝试了建议的解决方案。

因为我正试图在我的mac上安装jupyter,所以我升级了我的点子.它向我展示了一切都很好,但后来我注意到了这一点:

    Requirement already up-to-date: pip in /Library/Python/2.7/site-packages/pip-10.0.0b2-py2.7.egg (10.0.0b2)
     matplotlib 1.3.1 requires nose, which is not installed.
     matplotlib 1.3.1 requires tornado, which is not installed.
     matplotlib 1.3.1 has requirement numpy>=1.5, but you'll have numpy 1.8.0rc1 which is incompatible.

这是什么意思？即使我没有numphy> = 1.5,我的matplotlib也能正常工作吗？

我尝试修复它像建议matplotlib 1.3.1有要求numpy> = 1.5,但你会有numpy 1.8.0rc1这是不兼容但它不起作用:

sudo -H pip install numphy

Password:
Requirement already satisfied: numphy in /Library/Python/2.7/site-packages (0.0.1)
matplotlib 1.3.1 requires nose, which is not installed.
matplotlib 1.3.1 requires tornado, which is not installed.
matplotlib 1.3.1 has requirement …

我在ubuntu机器上安装了tensorflow docker容器.tensorflow docker 设置说明指定:

docker run -it b.gcr.io/tensorflow/tensorflow

这使我进入docker容器终端,我可以运行python并执行Hello World示例.我也可以手动运行.\ run_jupyter.sh来启动jupyter笔记本.但是,我无法从主机到达笔记本电脑.

如何启动jupyter笔记本,以便我可以使用主机上的笔记本电脑？理想情况下,我想使用docker启动容器并在单个命令中启动jupyter.

我正在努力为python做一些科学的东西设置一个良好的环境.为此,我安装了Jupyter和miniconda.

然后我希望能够拥有不同的环境,并将它们与Jupyter笔记本一起使用.所以我用conda创建了两个自定义env:py27和py35.

> conda env list
# conda environments:
#
py27                     /Users/***/miniconda3/envs/py27
py35                     /Users/***/miniconda3/envs/py35
root                  *  /Users/***/miniconda3

然后在我的笔记本上我有两个内核python 2和python 3.在笔记本内部,我使用python3内核获得以下内容:

> import sys
> print(sys.executable)
/Users/***/miniconda3/envs/py35/bin/python

这与python2内核:

> import sys
> print(sys.executable)
/usr/local/opt/python/bin/python2.7

• 如何设置sys.executable为python2的miniconda env？
• 如何将conda env与笔记本内核绑定？
• 正在做source activate py35一个链接jupyter notebook吗？

我想我真的错过了什么.

谢谢大家.

---编辑

我有多个jupyter bin:

> where jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/usr/local/bin/jupyter
/Users/ThomasDehaeze/miniconda3/bin/jupyter

我这里只有一个内核/usr/local/share/jupyter/kernels/python2.但在Jupyter里面,我有两个内核,python2而且python3.我在哪里可以找到另一个？

我修改kernel.json自/usr/local/share/jupyter/kernels/python2:

{
 "display_name": "Python 2",
 "language": "python", …