有没有办法从具有函数 metaMDS 的 NMDS 对象确定解释的累积方差(度量拟合或 R^2m)?该对象返回压力、分数、分数的值,但我没有看到差异。该函数来自 vegan 包并执行非度量多维缩放。
metaMDS(comm, distance = "bray", k = 2, try = 20, trymax = 20,
engine = c("monoMDS", "isoMDS"), autotransform =TRUE,
noshare = (engine == "isoMDS"), wascores = TRUE, expand = TRUE,
trace = 1, plot = FALSE, previous.best, ...)
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我读到 R^2 是 1-总压力?
感谢任何建议。