我正在创建一个简单的 Snakemake 管道,其中包含 Snakefile 中的全局变量。在我的规则中调用的 Python 脚本中使用这些全局变量的推荐方法是什么?
我目前正在使用 argparse 命令行参数,如此处所述(Snakemake:将命令行参数传递给脚本),但我想知道是否有更好的方法。
python snakemake
python ×1
snakemake ×1