标签: scatter-plot

我正在尝试自动更新散点图.我的X和Y值的来源是外部的,数据会以非预测的时间间隔(轮次)自动推送到我的代码中.

我只是设法在整个过程结束时绘制所有数据,而我正在尝试不断添加数据并将数据绘制到我的画布中.

我得到的(在整个运行结束时)是这样的:

然而,我所追求的是:

我的代码的简化版本:

import matplotlib.pyplot as plt

def read_data():
    #This function gets the values of xAxis and yAxis
    xAxis = [some values]  #these valuers change in each run
    yAxis = [other values] #these valuers change in each run

    plt.scatter(xAxis,yAxis, label  = 'myPlot', color = 'k', s=50)     
    plt.xlabel('x')
    plt.ylabel('y')
    plt.show()

我对 matplotlib 很陌生，我想知道如何根据列表中的值更改散点图上点的颜色。

事实上，我有一个要绘制的二维数组和一个行数相同的列表，其中每个点都包含我们要使用的颜色。

#Example
data = np.array([4.29488806,-5.34487081],
[3.63116248,-2.48616998],
[-0.56023222,-5.89586997],
[-0.51538502,-2.62569576],
[-4.08561754,-4.2870525 ],
[-0.80869722,10.12529582])
colors = ['red','red','red','blue','red','blue']
ax1.plot(data[:,0],data[:,1],'o',picker=True)

如何设置颜色参数以适合我的颜色列表？

我想根据2个外部向量的值制作不同标记和不同颜色的图.

在这里我尝试过:

>>> s = [u'+', u'+', u'o']
>>> col = ['r','r','g']
>>> x = np.array([1,2,3])
>>> y = np.array([4,5,6])
>>> pl.scatter(x,y,marker=s,c=col)
Traceback (most recent call last):
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/matplotlib/markers.py", line 233, in set_marker
    Path(marker)
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/matplotlib/path.py", line 133, in __init__
    vertices = np.asarray(vertices, np.float_)
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/numpy/core/numeric.py", line 460, in asarray
    return array(a, dtype, copy=False, order=order)
ValueError: could not convert string to float: '+'

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line …

我正在尝试使用 ggplot2 创建一个对数间隔网格的图，如下图所示。我得到等距网格，但没有记录间隔网格。我知道我缺少一些我现在似乎没有得到的参数。我已经看到很多关于这个主题的问题，比如使用 ggplot2 (dynamic not manual) 对数正常刻度的漂亮刻度，但没有解决我正在寻找的问题。

set.seed(5)
x <- rlnorm(1000, meanlog=3.5, sdlog=1)
y <- rlnorm(1000, meanlog=4.0, sdlog=1)
d <- data.frame(x, y)

plot(x, y, log="xy", las=1)
grid(nx=NULL, ny=NULL, col= "blue", lty="dotted", equilogs=FALSE)
library(magicaxis)
magaxis(side=1:2, ratio=0.5, unlog=FALSE, labels=FALSE)

library(ggplot2)
library(MASS)
library(scales)
a <- ggplot(d, aes(x=x, y=y)) + geom_point() +
     scale_x_log10(limits = c(1, NA), 
                   labels = trans_format("log10", math_format(10^.x)),
                   breaks=trans_breaks("log10", function(x) 10^x, n=4)) +
     scale_y_log10(limits = c(1, NA),
                   labels = trans_format("log10", math_format(10^.x)),
                   breaks=trans_breaks("log10", function(x) 10^x, n=4)) +
     theme_bw() + theme(panel.grid.minor …

我尝试使用下面的代码生成,将有斜体的相关系数简单的散点图[R置于情节.

data(mtcars)

# Load required libraries
require(ggplot2)               # To derive the graphs
require(ggthemes)              # To apply ggplot themes to the chart
require(scales)                # For pretty breaks

# Function to generate correlation coefficient for the charts
corr_eqn <- function(x,y, digits = 2) {
  corr_coef <- round(cor(x, y), digits = digits)
  corr_coef <- expression(paste(italic(r)," = ", corr_coef))
  return(corr_coef)
}

# Provide a scatter plot for income and health deprivation
ggplot(mtcars, aes(x = drat, y = wt)) +
  geom_point(shape = 19, …

在matplotlib该散点图提供了使用曲线的颜色来指示值或量值这样的情节的可能性:

因为bokeh,类似的例子似乎手动生成rgb颜色,这使得难以生成具有按比例缩放的颜色的图,尤其是.WRT.发散的彩色图.

是否可以在颜色图中设置相似的功能bokeh或matplotlib设置颜色？

我想生成一个pandas DataFrame的散点图,其中包含分类行和列标签matplotlib.示例DataFrame如下所示:

import pandas as pd
df = pd.DataFrame({"a": [1,2], "b": [3,4]}, index=["c","d"])
#   a  b
#c  1  2
#d  3  4

标记大小是相应DataFrame值的函数.到目前为止,我提出了一个尴尬的解决方案,基本上枚举行和列,绘制数据,然后重建标签:

flat = df.reset_index(drop=True).T.reset_index(drop=True).T.stack().reset_index()
#   level_0  level_1  0
#0        0        0  1
#1        0        1  2
#2        1        0  3
#3        1        1  4

flat.plot(kind='scatter', x='level_0', y='level_1', s=100*flat[0])
plt.xticks(range(df.shape[1]), df.columns)
plt.yticks(range(df.shape[0]), df.index)
plt.show()

哪种作品.

现在,问题:是否有更直观,更集成的方法来生成此散点图,理想情况下不分割数据和元数据？

我正在尝试使用ggplot绘制一些数据,并且我对重要的行和星号有一些问题.

这是我正在使用的代码:

p <- ggplot(Hematoxilin_tumor_necrosis, aes(x=total, y=necro, colour = Group))+
  labs(y="Necrotic area",x="Total area")+
  theme_minimal()

path = data.frame(x=c(78,79,79,78),y=c(22,22,34,34))

p + geom_point(size=0.7)+
  geom_smooth(method=lm, se = F, size=0.8) +
  scale_color_manual(values=c("#999999","#333333"))+
  #Adding asterisks
  geom_path(data = path, aes(x = x,y = y)) +
  annotate("text",x = 80, y = 27, label="*", cex=7)

这给了我以下错误:

FUN中的错误(X [[i]],...):找不到对象'组'

我知道问题出在了,geom_path(data = path, aes(x = x,y = y))但我有点迷茫.我是ggplot的新手,所以我期待一些简单的问题.

有什么建议？

我有一套要点:

a = ([126, 237, 116, 15, 136, 348, 227, 247, 106, 5, -96, 25, 146], [117, 127, 228, 107, 6, 137, 238, 16, 339, 218, 97, -4, -105])

我像这样制作一个散点图:

    fig = plt.figure(figsize = (15,6))
    ax = fig.add_subplot(111)
    ax.scatter(a[0], a[1], color = 'red', s=binradius)

这使得这个情节:

-

我将其与图片重叠,其中每个散点处都有一个球形斑点.我想要适合这个blob,所以我在散点周围定义了一个矩形区域,以便进行拟合.

我想在图上看到这个矩形,以便在视觉上看它们是否足够大以包围blob,如下所示:

我能用scatter吗？或者还有其他方法可以做到吗？

是否可以向a添加多个数据pandas.tools.plotting.scatter_matrix并为每组数据指定颜色？

我想用一组数据显示带有数据点的散点图,比如绿色,另一组用红色表示相同的散布矩阵.同样适用于对角线上的密度图.我知道这可以通过使用matplotlib的scatter函数来实现,但这并没有给我一个散点矩阵.

大熊猫的文件很清楚.