无法在 dockerfile 中创建 conda env

Question

我的environment.yml应用程序文件夹中有一个

我的 dockerfile 中有这个：

RUN conda env create
RUN source activate myenvfromymlfile

当我运行容器时，虽然 env 未激活。如果我do conda env list看到/opt/conda被激活：

root@9c7181cf86aa:/app# conda env list
# conda environments:
#
myenvfromymlfile         /opt/conda/envs/myenvfromymlfile
root                  *  /opt/conda

如果我附加到容器，我可以手动运行source activate myenvfromymlfile并且它可以工作，但是为什么在 RUN 指令中不起作用？

在示例中，我经常在需要 conda 的 dockerfiles 中看到这一点：

CMD [ "source activate your-environment && exec python application.py" ]

有人可以解释为什么有必要使用 && 使其成为单个命令吗？为什么在 RUN 指令中运行“source activate”不起作用？我想让我的 dockerfile 看起来像这样：

RUN conda env create
RUN source activate myenvfromymlfile
ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["application.py"]

Answer 1

考虑下面的 Dockerfile

RUN conda env create
RUN source activate myenvfromymlfile
ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["application.py"]

声明#1 conda env create。创建环境并更改磁盘上的文件。

声明#2 source activate myenvfromymlfile。在 bash 会话中加载一些东西。此处未进行磁盘更改

语句 #3 和 #4 指定运行容器时会发生什么

ENTRYPOINT ["python"]
CMD ["application.py"]

所以现在当你运行容器时。您在第 2 步中所做的任何事情都不存在，因为启动了一个 shell 来运行第 2 步，当它完成时，shell 已关闭。现在，当您运行图像时，会启动一个新的 shell，它是全新的 shell，现在不知道您过去在 dockerfile 中运行过source activate myenvfromymlfile

现在您想application.py在您创建的环境中运行它。docker 的默认 shell 是sh -c. 所以当你设置CMD如下

CMD [ "source activate your-environment && exec python application.py" ]

在容器启动时执行的最终命令变为

sh -c "source activate your-environment && exec python application.py"

它激活当前 shell 中的环境，然后运行您的程序。