将循环中的图保存在R中

Question

昨天我将R升级到版本3.0.0,将ggplot2升级到版本0.9.3.1(并对我的脚本进行了一些小改动).现在我在尝试保存绘图时遇到错误 - 遗憾的是错误不是用较小的数据帧重现的,所以我已经包含了生成相同大小的代码.

library("ggplot2")

# Create data frame
# Time interval ID (x)
bin.ts.avg <- as.data.frame(rep(1:18, 31))
names(bin.ts.avg) <- "x"
# Time (sequence of 10 minuter intervals between 7am and 10am)
tt.month.bins <- seq(from=as.POSIXct("2012-01-01 GMT"), to=as.POSIXct("2012-01-01 GMT") + 60*60*24*31, by="10 mins")
tt.month.bins <- tt.month.bins[-length(tt.month.bins)]
temp <- as.numeric(format(tt.month.bins, "%H"))
ind <- which(temp >=7 & temp <= 9)  
tt.month.bins <- tt.month.bins[ind]
bin.ts.avg$dep <- tt.month.bins
# Value (with some NA)
bin.ts.avg$tt <- runif(558, min=2.5, max=5)
bin.ts.avg$tt[trunc(runif(200, min=1, max=558))] <- NA
# Day
bin.ts.avg$depday <- rep(1:31, each=18)

for (i in 1:2){
  if (1){
    hist(rnorm(100))
    dev.print(file="MyHist.png",device=png, bg="white",  width=640, height=352) 

    p <- ggplot(bin.ts.avg, aes(x, tt)) + geom_point() +geom_line() + facet_grid(.~depday)
    p <- p + ggtitle("10 minute averages")+ xlab("Hour") + ylab("Values")    
    p <- p + scale_x_continuous(breaks=c(min(bin.ts.avg$x), max(bin.ts.avg$x)), labels=c("7", "10"))
    print(p)  
    dev.print(file="MyGGPlot.png",device=png, bg="white",  width=640, height=352) 
  }
}

运行此脚本时,我收到以下错误消息:

UseMethod中的错误("深度"):没有适用于"深度"的方法应用于类"NULL"的对象

但是,如果我逐行运行脚本,一切运行正常(下图). 现在,如果我更改for循环并使用dev.copy和ggsave而不是dev.print,如下所示

for (i in 1:2){
  if (1){
    hist(rnorm(100))
    dev.copy(file="MyHist.png",device=png, bg="white",  width=640, height=352) 
    dev.off()

    p <- ggplot(bin.ts.avg, aes(x, tt)) + geom_point() +geom_line() + facet_grid(.~depday)
    p <- p + ggtitle("10 minute averages")+ xlab("Hour") + ylab("Values")    
    p <- p + scale_x_continuous(breaks=c(min(bin.ts.avg$x), max(bin.ts.avg$x)), labels=c("7", "10"))
    print(p)  
    ggsave(filename="MyGGPlot.png")
  }
}

在尝试使用Paint打开"MyGGPlot.png"时,我收到一条错误消息

A sharing violation occurred while accessing <filename>

我使用RStudio版本0.97.449运行脚本.关于我需要改变什么以保存当前情节的任何想法？

Answer 1

几点

graphics.off()之后使用dev.copy.这将关闭所有图形设备.你也可以调用dev.off()两次(但它graphics.off()是一个基本上会调用dev.off()足够时间来关闭所有图形设备的包装器

ggsave不需要print编辑对象(这是不是在那里的情况下,FAQ 7.22是相关的).

默认值last_plot是ggplot创建,修改或打印的最后一个对象的值.因此,创建p足以 ggsave('filname.png')保存该对象.

for (i in 1:2){
  if (1){
    hist(rnorm(100))
    dev.copy(file="MyHist.png",device=png, bg="white",  width=640, height=352) 
    graphics.off()

    p <- ggplot(bin.ts.avg, aes(x, tt)) + geom_point() +geom_line() + facet_grid(.~depday)
    p <- p + ggtitle("10 minute averages")+ xlab("Hour") + ylab("Values")    
    p <- p + scale_x_continuous(breaks=c(min(bin.ts.avg$x), max(bin.ts.avg$x)), labels=c("7", "10"))
   # no need to print p
   ggsave(filename="MyGGPlot.png")
   # note specifying p is redundant but explicit.
   # ggsave(filename = 'MyGGplot.png', plot = p)
  }
}