我需要对bed文件随机排序10000 次，每次取前 1000 行。目前，我正在使用以下代码：
for i in {1..100}; do
for j in {1..100}; do
sort -R myfile.bed_sorted | tail -n 1000 > myfile.bed.$i.$j.bed
done
done
为每个文件执行此操作需要将近 6 个小时。我有大约 150 个需要解决。有没有更快的解决方案？
我有一个数据样本（myfile.bed_sorted）：
chr1 111763899 111766405 peak1424 1000 . 3224.030 -1 -1
chr1 144533459 144534584 peak1537 998 . 3219.260 -1 -1
chr8 42149384 42151246 peak30658 998 . 3217.620 -1 -1
chr2 70369299 70370655 peak16886 996 . 3211.600 -1 -1
chr8 11348914 11352994 peak30334 990 . 3194.180 -1 -1
chr21 26828820 …我有一个包含大约 150 个文本文件的文件夹。我想以 150 个文件的名称创建文件夹。之后，我希望将文本文件移动到其各自的文件夹中。
myfolder 目录中文件的示例名称：
~/myfolder/
|______ ajhaslf.txt
|______ oiueed.txt
|______ dsflije.txt
我希望我的新结构如何：
~/myfolder/
|______ ajhaslf
|____ajhaslf.txt
|______ oiueed
|____oiueed.txt
|______ dsflije
|____dsflije.txt
当然，使用文件名创建目录对我来说不是问题mkdir。
我想合并包含不同行数但列数相同的两个 txt 文件中的特定列（如下所示）：
file1:
xyz desc1 12
uvw desc2 55
pqr desc3 12
file2:
xyz desc1 56
uvw desc2 88
Preferred output:
xyz desc1 12 56
uvw desc2 55 88
pqr desc3 12 0
目前我使用 awk 作为粘贴命令：
paste <(awk '{print $1}' file1) <(awk '{print $2}' file1) <(awk '{print $3}' file1) <(awk '{print $3}' file2)
但这似乎只合并重叠的列。awk 中有没有办法插入零而不是省略行本身？
我需要将 100 个文件组合在一起，这样我的输出文件将包含 102 列。
我有一个包含 61000 列和 173 行的文本文件。我想合并每 2 列的数据，即第 1 列和第 2 列应该合并，第 3 列和第 4 列应该合并，第 5 列和第 6 列应该合并，依此类推。
示例输入（制表符分隔）：
Ind Pop scaffold1 X scaffold1 X.1 scaffold3 X.2 scaffold4 X.3
a antartica 1 1 1 1 2 2 1 1
b antartica 1 1 1 1 2 1 1 2
c antartica 1 1 1 1 2 1 1 1
d antartica 1 1 1 1 2 1 1 2
e antartica 1 1 1 1 2 1 1 2 …