bio*_*han 5 awk text-processing paste
我想合并包含不同行数但列数相同的两个 txt 文件中的特定列(如下所示):
file1:
xyz desc1 12
uvw desc2 55
pqr desc3 12
file2:
xyz desc1 56
uvw desc2 88
Preferred output:
xyz desc1 12 56
uvw desc2 55 88
pqr desc3 12 0
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目前我使用 awk 作为粘贴命令:
paste <(awk '{print $1}' file1) <(awk '{print $2}' file1) <(awk '{print $3}' file1) <(awk '{print $3}' file2)
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但这似乎只合并重叠的列。awk 中有没有办法插入零而不是省略行本身?
我需要将 100 个文件组合在一起,这样我的输出文件将包含 102 列。
如果列顺序很重要,即来自同一文件的数字应保留在同一列中,则需要在读取不同文件时添加填充。这是使用 GNU awk 的一种方法:
合并.awk
# Set k to be a shorthand for the key
{ k = $1 SUBSEP $2 }
# First element with this key, add zeros to align it with other rows
!(k in h) {
for(i=1; i<=ARGIND-1; i++)
h[k] = h[k] OFS 0
}
# Remember the data element
{ h[k] = h[k] OFS $3 }
# Before moving to the next file, ensure that all rows are aligned
ENDFILE {
for(k in h) {
if(split(h[k], a) < ARGIND)
h[k] = h[k] OFS 0
}
}
# Print out the collected data
END {
for(k in h) {
split(k, a, SUBSEP)
print a[1], a[2], h[k]
}
}
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以下是一些测试文件:f1、f2和:f3f4
$ tail -n+1 f[1-4]
==> f1 <==
xyz desc1 21
uvw desc2 22
pqr desc3 23
==> f2 <==
xyz desc1 56
uvw desc2 57
==> f3 <==
xyz desc1 87
uvw desc2 88
==> f4 <==
xyz desc1 11
uvw desc2 12
pqr desc3 13
stw desc1 14
arg desc2 15
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awk -f merge.awk f[1-4] | column -t
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输出:
pqr desc3 23 0 0 13
uvw desc2 22 57 88 12
stw desc1 0 0 0 14
arg desc2 0 0 0 15
xyz desc1 21 56 87 11
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awk -f merge.awk f2 f3 f4 f1 | column -t
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输出:
pqr desc3 0 0 13 23
uvw desc2 57 88 12 22
stw desc1 0 0 14 0
arg desc2 0 0 15 0
xyz desc1 56 87 11 21
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如果输出应以制表符分隔,请相应地设置输出字段分隔符:
awk -f merge.awk OFS='\t' f[1-4]
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