我过去成功地使用过 egrep，通常使用以下
egrep -f list_of_patterns big_file_to_look_for_patterns > selected_patterns_from_big_file
然而，我今天早上一直在尝试做同样的事情，但我不断地将所有内容作为输出 -> 不仅是我通过列表提供的模式，还有我正在查看的整个文件
文件可以在这里找到：https : //filebin.net/ibovbjy68x4a8kez
模式列表：“allMAGs_list_85_5_list”
big_file_to_look_for_patterns: "goodfile"
根据之前有类似 grep 问题的人的帖子，我试图tr '\r' '\n'消除马车，但这并没有帮助......
提前致谢
首先注意：egrep已弃用，可以在某些时候删除，请grep -E改用。现在您的问题是您的模式文件包含空行。因此，grep 正在寻找在所有行中都可以找到的空字符串，以便返回所有结果。你可以在这里看到同样的事情：
$ seq 10 | grep ""
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
只需从文件中删除空行并重试：
sed '/^$/d' allMAGs_list_85_5_list > fixed.list
grep -Ef fixed.list goodfile
您还可以修复原始列表文件
sed -i '/^$/d' allMAGs_list_85_5_list
或即时进行
grep -Ef <(sed '/^$/d' allMAGs_list_85_5_list) goodfile