为什么 R 无法将绘图渲染为 PNG 文件？

Question

我试图让 R 在 UNIX 中做一些非常基本的绘图等，但是我收到了一个与 X11 相关的奇怪错误，据我所知，我什至不需要 X11。

我有一个矩阵名称d，想保存该矩阵的热图图像，而无需实际显示图像（因为我不想使用 X11）。这是我的代码：

png(file="my_image.png")
heatmap(d)
dev.off()

问题是我收到以下错误：

Error in X11(paste("png::", filename, sep = ""), g$width, g$height, pointsize,  :
  unable to start device PNG

另外： 警告信息：

In png(file = "interative_hen.png") :
  unable to open connection to X11 display ''

我不知道这种情况正在发生，因为我不知道 R 是如何需要 X11 的，即使它需要 X11，X11 也已安装并为我测试过的每个应用程序正常工作。

Answer 1

首先，检查R您使用的版本是否具有 PNG 功能。您可以通过从提示符调用该capabilities()函数来完成此操作R。它应该打印出类似于以下内容的列表：

> capabilities()

jpeg    png    tiff    tcltk  X11    aqua     http/ftp  sockets
FALSE   FALSE  FALSE   TRUE   FALSE  FALSE    TRUE      TRUE

libxml  fifo   cledit  iconv  NLS    profmem  cairo
TRUE    TRUE   TRUE    TRUE   TRUE   FALSE    FALSE 

如果您看到FALSE下面的内容png，那么您需要R使用显式 PNG 支持手动重新编译。只要您安装了必要的构建依赖项，构建过程就会自动启用 PNG 功能。

最后，假设集群上没有运行本地 X 服务器，您的 SSH 客户端可能未正确配置 - 具体来说，请确保您已启用 X11 转发（如果您使用的是类似 UNIX 的工具，请使用-X或标志）。或者，您可以尝试使用虚拟帧缓冲区。-Yssh

有关详细信息，请参阅此堆栈溢出问题：如何在没有 X11 的服务器上运行 R，并避免损坏的依赖项。