我编写了一个使用numpy，multiprocessing，tqdm和其他一些Python库的python脚本。另外，我运行的软件包（例如samtools，bwa，GATK）设置为必须在linux中安装（apt-get install）。
我想以某种方式包装所有这些依赖项，以使最终安装尽可能地对用户友好且稳定。
似乎pip不是一个选项，因为在我的示例中包含了非python软件包。
也许可以使用Docker或创建具有所有这些依赖关系的conda环境，但是我并没有真正了解如何进行管理。
想象一张这样的表：
name | value
-----|------
Jack | 0
Jack | 1
Jack | 0.5
Jack | 1
Jill | 0
Jill | 2
对于每个名字，我想要累积平均值，如下所示：
name | value | cumAverage
-----|-------|-----------
Jack | 0 | 0
Jack | 1 | 0.5
Jack | 0.5 | 0.5
Jack | 1 | 0.625
Jill | 0 | 0
Jill | 2 | 1
因此，每当出现新名称时，累积平均值应“重新启动”。名称列已排序，因此每当出现新名称时，当前累积平均值就完成了。