我正在尝试运行一些生物信息学软件(TE Displayer),但它根本不起作用.我认为问题可能在于软件如何识别FASTA标头.从文档中可以看出这一点.
标题行中的序列标识符采用"\ w(1,10)\ d(2,9)"的模式,表示"单词字符(1-10)后跟数字(2-9)",因此请尽量避免标题行中的非标识符短语(例如"Build04").例如标题行"> OrganismX Accession AC000282,build0.4"很好,但不是"> OrganismX Contig WX000282,Build04".因此,"> Oryza sativa Chromosome11"也会很好,因为"Chromosome11"将被识别为标识符.
有人可以解释"\ w(1,10)\ d(2,9)"的确切用法我理解为总共最多12个字符的任何单词但它必须以两位数结尾.所以我不明白Build0.4如何正常,而Build04不是很好.
干杯!
在阅读这篇文章时,我被困在这里.我从链接中粘贴了这个.我不明白为什么List<Number>或List<? extends Number>不能在这里使用的推理.
public void doStuff( List<Integer> list ) {
list.add(1);
// do stuff
list.get(0);
}
We can generalize this one step further by generalizing the generic parameter:
public void doStuff( List<? super Integer> list ) {
list.add(1);
// do stuff
list.get(0);
}
有些读者可能会问为什么更直观的List <Number>不能在这里使用.实际上,我们可以尝试将方法定义为采用List <Number>或List <？扩展Number>,但是第一个定义将排除传入实际ArrayList <Integer>的可能性,而第二个定义将禁止add()方法(因为有人可能会传入ArrayList <Float>,并且会找到调用doStuff后,在Floats之间的整数).
我find在 Mac OS X 10.9 中使用该命令，我尝试过这样的命令：
$ touch "a gre a"
$ find -E . -iregex ".*\bgre\b.*"
看起来find不会返回这个名为a gre a.. 的文件。有没有人对此有想法？谢谢！
这里我想删除某些行文件的第一个字符。例如：
>cat file1.txt
10081551
10081599
10082234
10082259
20081134
20081159
30082232
10087721
从第 3 行到第 7 行删除第一个字符sed命令或任何其他字符，输出将是：
>cat file1.txt
10081551
10081599
0082234
0082259
0081134
0081159
0082232
10087721
在bash我想要替换
H+O2=O+OH
同
H+O_2=O+OH
我用awk和sed尝试了无数的东西但到目前为止没有任何工作.问题是我不知道如何保存字符串,然后只需添加_而不是替换O或2.谢谢!
这两个Bash命令有什么区别？:
bash <(curl -sL https://raw.githubusercontent.com/node-red/raspbian-deb-package/master/resources/update-nodejs-and-nodered)
curl -sL https://raw.githubusercontent.com/node-red/raspbian-deb-package/master/resources/update-nodejs-and-nodered | bash
第一个命令给了我这个提示:
Are you really sure you want to do this ? (y/N) ?
但第二个没有.
我在解决有关最小生成树的问题时遇到了一些麻烦。因此，图中的每个节点都是一个城市，并且可能具有连接两个节点的权重边，这就是在两个城市之间修建道路的成本。问题基本上是告诉人们修路的最低成本，并使所有城市都以某种方式连接。我可以通过使用Prim或kruskal算法轻松解决此最大问题的子问题。
现在最棘手的部分是：每个城市（节点）都可以有一个机场，而每个机场都有一次成本（如果您决定建造）。如果两个城市都有机场，则可以使用机场在两个城市之间旅行。现在，我必须计算建造道路和机场的最低成本，以使所有城市都连接起来，但是我很难用网络的其余部分来表示与机场的连接。有人可以帮我吗？也许我对使用MST是完全错误的？
我想出的唯一解决方案是：对于每个有机场的城市，我都会将该城市与另一个有机场的城市连接起来。另外，如果建造两个机场的成本较低，那么建造道路的成本也应考虑在内。我运行kruskal是为了获得最便宜的边缘，但是如果kruskal选择“机场”边缘，我会将其添加到生成树中，然后将这两个机场的成本设为0（如果它们以前没有建造过）。我相信，通过在运行kruskal时进行动态权重更改，我正在破坏获得最低成本的想法。
我有很多矩形,我试图生成一个不在任何一个内部的随机点.我创建了一个方法来执行此操作,但似乎这导致我的应用程序冻结,因为它必须在生成有效点之前经过大量的点:
public Point getLegalPoint() {
Random generator = new Random();
Point point;
boolean okPoint = true;
do {
point = new Point(generator.nextInt(975), generator.nextInt(650));
for (int i = 0; i < buildingViews.size(); i++) {
if (buildingViews.get(i).getBuilding().getRectangle()
.contains(point)) {
okPoint = false;
break;
}
}
} while (okPoint == false);
return point;
}
有什么我做错了,或者有更有效的方法来做它,以便它不会冻结我的应用程序？
好吧,这是一个奇怪的跨平台的事情,我正在经历文本文件.假设我有一个非常简单地读取文本文件的程序
// reading a text file
#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
using namespace std;
int main () {
string line;
ifstream myfile ("example.txt");
if (myfile.is_open())
{
while ( myfile.good() )
{
getline (myfile,line);
if (line == "BEGIN")
cout << line << endl;
}
myfile.close();
}
else cout << "Unable to open file";
return 0;
}
所以这会读取一个文本文件并在遇到BEGIN时吐出正在读取的行.这是我正在阅读的文本文件:
HEADER
BEGIN
X 2
Y 2
Z 1
END
Windows成功吐出BEGIN一次,因为它遇到了一次.Linux没有吐出任何东西.我在这里缺少一些基本的东西吗？
似乎在我的方差计算中na.rm=T的apply函数内：
poolvarcheck=((7037*(apply(yes, 2, var, na.rm=T)))+(5394*(apply(no,2,var,na.rm=T))))/12431
导致此警告消息：
"在 if (na.rm) "na.or.complete" else "everything" 中：条件长度 > 1 并且只使用第一个元素"
我环顾四周，这似乎主要适用于循环或 if 子句，但我想知道 1）这是否会影响我的结果以及如何影响，以及 2）是否有办法避免警告。