我正在研究一种可视化RNA二级结构的工具,为此我已经实现了Nussinov算法,该算法生成RNA二级结构作为列表,带有相应的索引,代码可以在这里找到[0]
但我真的坚持理解我应该如何将其可视化(作为平面图),上面的代码给出了二级结构的顺序列表,所以有人可以建议我如何可视化结构.这样的一个例子工具可以在这里找到[1]
[1] http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAfold.cgi
而且我知道有更好的算法但是现在我只想用这个可视化,一旦我理解了可视化,我会寻求更好的算法.