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我正在尝试使用 Dockerfile 安装 R 包。

我安装了图像Rocker/Rstudio。

Dockerfile的内容是：

# Base image https://hub.docker.com/r/rocker/rstudio\nFROM rocker/rstudio:latest\n\n## Create directories\nRUN mkdir -p /rstudio\nRUN mkdir -p /rscripts\n\n\n##Install R packages\nRUN R -e "install.packages(c(\'rvest\', \'jsonlite\', \'data.table\' ,\'stringr\'), repos = \'http://cran.us.r-project.org\')"\n

然后我构建我的图像执行：docker build -t my_r_image .\n图像构建但软件包未安装，因为我收到此警告：

\n

Installing packages into \xe2\x80\x98/usr/local/lib/R/site-library\xe2\x80\x99 (as \xe2\x80\x98lib\xe2\x80\x99 is\n unspecified) Warning: unable to access index for repository\n http://cran.us.r-project.org/src/contrib: cannot open URL\n \'http://cran.us.r-project.org/src/contrib/PACKAGES\'

\n

I tried by replacing http://cran.us.r-project.org by = \'http://cran.rstudio.com/\')" but …

每次我重新启动 ec2 服务器时，我都必须执行以下操作： sudo systemctl start docker然后docker-compose up -d启动所有容器。
有没有办法在实例开始时自动运行这两个命令？我已经阅读了这个答案，我认为理想情况下我想知道如何做到这一点：

创建一个 systemd 服务并启用它。所有启用的系统服务将在通电时启动。

你知道如何创建这样的 systemd 服务吗？

[编辑 1]：按照 Chris William 的评论，这是我所做的：

谢谢 Chris，所以我创建了一个docker_boot.service，内容如下：

[Unit]
Description=docker boot
After=docker.service

[Service]
Type=simple
Restart=always
RestartSec=1
User=ec2-user
ExecStart=/usr/bin/docker-compose -f docker-compose.yml up

[Install]
WantedBy=multi-user.target

我在/etc/systemd/system文件夹中创建它

然后我做了：

sudo systemctl enable docker
sudo systemctl enable docker_boot

当我打开服务器时，唯一正在运行的 Docker 图像是certbot/certbot和telethonkids/shinyproxy
请在我的docker-compose.yml文件内容下方找到。
您是否看到缺少什么以便所有图像都启动并运行？

version: "3.5"
services:
  rstudio:
    environment:
      - USER=username
      - PASSWORD=password
    image: "rocker/tidyverse:latest"
    build: …

我正在尝试在 EC2 实例上从 R 安装 readR 包。

我在这篇文章中找到了解决方案：

我想要 CentOS 的脚本，但答案是 Ubuntu：

[1] apt-get update     # refresh
[2] apt-get install software-properties-common
[3] add-apt-repository -y "ppa:marutter/rrutter"
[4] add-apt-repository -y "ppa:marutter/c2d4u"
[5] apt-get update     # now with new repos
[6] apt-get install r-cran-readr

下面是我的翻译尝试，我知道第 2 行在我的情况下不是必需的，我缺少的是允许在 CentOs 中添加存储库的两行：

sudo yum update
sudo mkdir ppa:marutter/rrutter
sudo mkdir ppa:marutter/c2d4u
sudo yum update
sudo yum install r-cran-readr

非常感谢帮助！

我已经构建了两个Docker 镜像，一个是我的rstudio镜像，另一个是运行我的 cronjobs（R 脚本）的cron镜像。 我正在构建其他图像（Shiny 等），它们需要与 cron 图像和 rstudio 图像完全相同的 R 包。 所以我想要一个文件，我可以在其中列出不同图像所需的所有 R 包。我的文件夹的结构如下：

??? cron
?   ??? crontab
?   ??? Dockerfile
??? rstudio
?   ??? Dockerfile
??? r_packages.txt

FROM rocker/tidyverse:3.6.1

## Create directories
RUN mkdir -p /rstudio
RUN mkdir -p /rscripts

RUN cat /home/ec2-user/r_packages.txt

R -e "install.packages(c('writexl','readxl','rjson','httr','rvest','DBI','RPostgres','stringr','xlsx','knitr','kableExtra','devtools','RSelenium'))"