小编Mar*_*ard的帖子

我正在尝试使用树状数据构建图形,其中节点通常分成> 2个边缘.我尝试了各种布局,我看到layout.reingold.tilford参数将生成具有非分叉数据的树状图.然而,产出并不是特别有吸引力.我宁愿使用类似layout.lgl或layout.kamada.kawai的东西,因为它们会产生更多的径向结构.我无法看到如何更改R中的参数,使这些树没有重叠的边缘.这可能吗？

我以Pajek格式导入了一个简单的数据文件,包含355个节点和354个边缘.我目前正在使用以下方式打印它:

plot.igraph(g,vertex.size=3,vertex.label=NA,layout=layout.lgl)

这给了我这样的输出,这很好,但仍然有重叠的边缘.我已经读过你可以使用tkplot或者像cytoscape这样的其他程序手动修复它,但是我有很多这样的构建,并且它们的大小使得手动修正变得麻烦.

非常感谢.