当尝试cor()在稀疏矩阵(dgCMatrix或dgTMatrix类型)上运行该函数时,我收到以下错误:
Error in cor(x) : supply both 'x' and 'y' or a matrix-like 'x'
将我的矩阵转换为密集将是非常低效的.有没有一种简单的方法来计算这种相关性(没有所有对循环？).
谢谢,
我正在使用Python脚本处理大型CSV文件(大约有几GB的10M行).
这些文件具有不同的行长度,无法完全加载到内存中进行分析.
每行都由我的脚本中的函数单独处理.分析一个文件大约需要20分钟,看起来磁盘访问速度不是问题,而是处理/函数调用.
代码看起来像这样(非常简单).实际代码使用Class结构,但这类似:
csvReader = csv.reader(open("file","r")
for row in csvReader:
handleRow(row, dataStructure)
鉴于计算需要共享数据结构,使用多个内核在Python中并行运行分析的最佳方法是什么？
一般来说,如何从Python中的.csv一次读取多行以传输到线程/进程？for在行上方循环听起来效率不高.
谢谢!
我正在写一些代码来执行一些博弈论模拟.我的"世界"有几个状态(在我的情况下说2个),它也有几个玩家(同样,2个),每个玩家都有一个支付矩阵(2乘2).
我尝试在R中创建以下多维数组:
U = array(2,2,2,2)
U[1][1] = cbind(c(0.7,0.3),c(0.3,0.7))
我收到以下错误:
number of items to replace is not a multiple of replacement length
我可以转到使用列表,其中每个项目将是两个项目A和B的列表,其中A和B是2x2矩阵.但是,我认为在列表上执行操作会变得很慢,并且矢量化很难.
是否有关于正确实施的建议或对上述代码无效的原因的解释？
更新:显然正确的语法是:
U[1,1, , ] = cbind(c(0.7,0.3),c(0.3,0.7))
我的问题仍然存在 - 哪个更好,多维向量或元组列表？
谢谢,
我正在编写R代码,我想让它以"非调试"或"调试"模式运行.在调试模式下,我希望代码打印出运行时信息.
在其他语言中,我通常会有某种打印功能,除非打开一个标志(用于编译或运行时),否则它什么都不做.
例如,我可以使用#ifdef DEBUG(在编译时),或者在运行时设置调试级别.
在R中这样做的等价方法是什么？
我正在编写一个多处理程序来使用Windows并行处理大型.CSV文件.
我找到了一个类似问题的优秀例子.在Windows下运行时,我收到一个错误,即csv.reader不是Picklable.
我想我可以在阅读器子流程中打开CSV文件,只需从父进程发送文件名即可.但是,我想传递一个已打开的CSV文件(就像代码应该这样做),具有特定的状态,即真正使用共享对象.
任何想法如何在Windows下或那里缺少什么？
这是代码(我为了便于阅读而重新发布):
"""A program that reads integer values from a CSV file and writes out their
sums to another CSV file, using multiple processes if desired.
"""
import csv
import multiprocessing
import optparse
import sys
NUM_PROCS = multiprocessing.cpu_count()
def make_cli_parser():
"""Make the command line interface parser."""
usage = "\n\n".join(["python %prog INPUT_CSV OUTPUT_CSV",
__doc__,
"""
ARGUMENTS:
INPUT_CSV: an input CSV file with rows of numbers
OUTPUT_CSV: an output file that will contain the sums\
"""])
cli_parser …我有一个由bigsplit()操作产生的列表列表(来自biganalytics包,bigmemory包的一部分).
每个列表表示矩阵中的列,并且每个列表项是二进制矩阵中值1的索引.
将此列表转换为稀疏二进制(0/1)矩阵的最佳方法是什么？在lapply()中使用lapply()是唯一的解决方案吗？如何将列表命名为列的名称？