所以我想为我的数据集拟合一个随机森林分类器.我是R的新手,我想这是一个简单的格式化问题.
我在一个文本文件中读取并转换我的数据集,因此它具有以下格式:(取出机密信息)
>head(df.train,2)
GOLGA8A ITPR3 GPR174 SNORA63 GIMAP8 LEF1 PDE4B LOC100507043 TGFB1I1 SPINT1
Sample1 3.726046 3.4013711 3.794364 4.265287 -1.514573 7.725775 2.162616 -1.514573 -1.5145732 -1.514573
Sample2 4.262779 0.9261892 4.744096 7.276971 -1.514573 4.694769 4.707387 2.031476 -0.8325444 2.615991
...
...
CD8B FECH PYCR1 MGC12916 KCNA3 resp
Sample1 -1.514573 2.099336 3.427928 1.542951 -1.514573 1
Sample2 -1.145806 1.204241 2.846832 1.523808 1.616791 1
本质上,列是我的特征,行是我的样本,最后一列是我的响应向量,它是一列因子,resp.
然后我用:
set.seed(1) #Set the seed in order to gain reproducibility
RF1 = randomForest(resp~., data=df.train,ntree=1000,importance=T,mtry=3)
只需尝试resp使用其他列作为功能在我的列上训练RF .
但是我得到了错误:
Error in eval(expr, …