小编Yih*_*Xie的帖子

我已经在Linux mint和Windows 7上安装了Sweave和knitr软件包,它在Windows上运行良好,但在Linux中使用rstudio时却失败了.安装pkgs后,我写了一个简单的dw.Rnw如下:

\documentclass{article}

\begin{document}

The regression model is as follows
<<echo=TRUE>>=
pop=read.table("pop.txt",header=TRUE)
attach(pop)

lm.sol=lm(y~year)
summary(lm.sol)
@


\end{document}

当我按下rstudio中的" 编译PDF " 按钮时,它会返回以下错误消息:

During startup - Warning messages:
1: Setting LC_CTYPE failed, using "C" 
2: Setting LC_COLLATE failed, using "C" 
3: Setting LC_TIME failed, using "C" 
4: Setting LC_MESSAGES failed, using "C" 
5: Setting LC_PAPER failed, using "C" 
6: Setting LC_PAPER failed, using "C" 
7: Setting LC_MEASUREMENT failed, using "C" 
> grDevices::pdf.options(useDingbats = …

在R中,capture.output()可以stdout将表达式中的输出捕获为字符向量,例如

> x = capture.output(print(1:10))
> x
[1] " [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10"

朱莉娅有同等的功能吗？

我不仅希望我的数字出现在我的knitr生成的报告中,而且我还希望将它们输出到单独的文件中.为此,我提供了如下代码:

```{r}
  #Plot figure in report
  plot(x,y)

  #Plot figure in file
  pdf(file="MyFig.pdf")
  plot(x,y)
  dev.off()
```

这很好用,但我希望有一个更优雅的解决方案,已经内置到knitr.是否有一个块选项或类似的东西可以实现相同的结果？

我希望在行中使用R代码作为ar markdown文件中标题的一部分.但是,当我编织文件时,标题上使用的字体是不同的.如何确保字体相同.一个简单的例子如下.

`r 1+1`  Header 
-------------------------

出于纪录目的,我想要一些html输出中的绘图代码,而不是绘图.之后,我必须调用绘图代码,并在绘图中添加一些内容,但只能看到附加代码.我试过这个:

```{r non.finished.plotting, eval=FALSE}
    plot(1,type="n")
```
Some explanatory text here in the output:
"This produces an empty plot, and we could now add some points to it manually."

```{r add.layer, fig.width=5, fig.height=5}
<<non.finished.plotting, echo=FALSE>>
points(x=rnorm(100,1,0.1), y=rnorm(100,0.8,0.1) )

```

我在Yihui的发现了echo符号,但是当我编织它时,我在输出中收到一条错误信息.

## Error: plot.new has not been called yet

我也尝试摆弄大块选项,但我找不到能满足我想要的组合.(对不起,这是非常基本的,但我没有找到类似这个例子的东西.)

我想创建一个tex表使用xtable().这是我在Win 7上使用相同R版本时的最小例子.

\documentclass[a4paper,12pt,twoside]{article}

\begin{document}

<<load-packages,include=TRUE,echo=TRUE>>=
library(xtable)
@

<<testing-xtable,echo=TRUE,cache=FALSE,include=TRUE>>=
tab <- matrix(1:50,nrow=10)
rownames(tab) <- letters[1:10]

print(
  xtable(
    x=tab,
    caption="A table",
    label="tab",
    align=rep("c",times=6),
    digits=3,
    display=rep("f",times=6)
    ), 
  sanitize.colnames.function=identity,
  include.rownames=FALSE,
  table.placement="h"
  )
@
\end{document}

我得到xlatex()了pdf文档中的逐字代码输出,而不是一个好的表.

这是knitr的输出:

> grDevices::pdf.options(useDingbats = FALSE); require(knitr); opts_knit$set(concordance     = TRUE); knit('xtable.Rnw', encoding='UTF-8')
Loading required package: knitr


processing file: xtable.Rnw
  |.............                                                    |  20%
  ordinary text without R code

  |..........................                                       |  40%
label: load-packages (with options) 
List of 2
 $ include: logi TRUE
 $ echo   : logi TRUE …

我们可以使用set.seed()在R中设置随机种子,这具有全局效应.这是一个简单的例子来说明我的目标:

set.seed(0)
runif(1)
# [1] 0.8966972

set.seed(0)
f <- function() {
  # I do not want this random number to be affected by the global seed
  runif(1)
}
f()
# [1] 0.8966972

基本上我希望能够避免全局随机种子(即.Random.seed)在本地环境(例如R函数)中的影响,这样我就可以实现用户无法控制的某种随机性.例如,即使用户有set.seed(),他每次调用此函数时仍会得到不同的输出.

现在有两个实现.第一个依赖于set.seed(NULL)让R每次想要得到一些随机数时重新初始化随机种子:

createUniqueId <- function(bytes) {
  withPrivateSeed(
    paste(as.hexmode(sample(256, bytes, replace = TRUE) - 1), collapse = "")
  )
}
withPrivateSeed <- function(expr, seed = NULL) {
  oldSeed <- if (exists('.Random.seed', envir = .GlobalEnv, inherits = FALSE)) {
    get('.Random.seed', envir = …

我有一个长的矢量字符串(DNA序列),最多可以添加到我的knitr报告输出中的几千个连续字符.RStudio在控制台中完美地处理文本包装,但是当我生成knitr html输出时,我只能看到一行文本,它只是在页面上运行.

RStudio输出

编织输出

任何调整knitr输出以包装文本的方法？

谢谢.

我安装了以下内容:

• RStudio的预览版,版本0.98.864(2014年5月24日)
• knitr和shiny的开发版本,通过devtools :: install_github(c("yihui/knitr","rstudio/shiny"))

我想用自定义CSS创建一个闪亮的演示文稿(RStudio菜单项:文件>新文件> RMarkdow>闪亮>闪亮的演示文稿),但我不确定如何这样做.

我的自定义CSS(目前只更改标题2的颜色)

h2 { 
 font-size:1.8em; 
 color: red;
}

使用ioslides网页上的RMarkdown PResentations提供的示例摘录:

---
title: "Habits"
author: John Doe
date: March 22, 2005
output:
  ioslides_presentation:
    css: temp.css
---

    ## Getting up

    - Turn off alarm
    - Get out of bed

但是,当我通过包含runtime: Shiny在前导码中将其转换为生成Shiny输出时,自定义格式不再有效.

---
title: "Habits"
author: John Doe
date: March 22, 2005
runtime: shiny
output:
  ioslides_presentation:
    css: temp.css
---


## Getting up

- Turn off alarm
- Get out of bed

## …

如何在前言,确认等方面获得罗马数字,并在R Bookdown第一章的第一页重启阿拉伯语编号为1.

我想在bookdown中呈现为pdf,但是没有找到关于如何更改页面编号的任何好信息

谢谢