小编Yih*_*Xie的帖子

在创建Rmd文件时,我包含了一个内部超链接:

   [hlink](#id1)  

然后进一步锚定

<a id="id1"></a> . 

当我然后使用Knit HTML(在RStudio中)一切正常并且内部超链接工作正常但我也得到了一个不需要的

<p><a id="id1"></a>?</p>

如何避免出现此错误？

我正在使用knitr来构建一个R包小插图.此过程在R 3.0之前有效,但我无法在R 3.1.1下重建该软件包.

当我尝试时R CMD build收到错误消息:

R CMD build Causata
* checking for file ‘Causata/DESCRIPTION’ ... OK
* preparing ‘Causata’:
* checking DESCRIPTION meta-information ... OK
* installing the package to build vignettes
* creating vignettes ...

ERROR Error in loadVignetteBuilder(vigns$pkgdir) :
  vignette builder 'knitr' not found Calls: <Anonymous> -> loadVignetteBuilder
In addition:
  Warning message: In tools::buildVignettes(dir = ".", tangle = TRUE) :
  Files named as vignettes but with no recognized vignette engine:
   ‘vignettes/Causata-vignette.rnw’ (Is a VignetteBuilder field …

我正在使用RStudio和knitr将.Rmd编织为.docx

我想在图标题中包含内联代码,例如块选项中的以下内容:

fig.cap =" nrow(data)数据点图"

但是,knitr不会评估此代码,而只是打印未评估的命令.

有没有办法让knitr来评估图/表格标题中的r代码？

我已经在Linux mint和Windows 7上安装了Sweave和knitr软件包,它在Windows上运行良好,但在Linux中使用rstudio时却失败了.安装pkgs后,我写了一个简单的dw.Rnw如下:

\documentclass{article}

\begin{document}

The regression model is as follows
<<echo=TRUE>>=
pop=read.table("pop.txt",header=TRUE)
attach(pop)

lm.sol=lm(y~year)
summary(lm.sol)
@


\end{document}

当我按下rstudio中的" 编译PDF " 按钮时,它会返回以下错误消息:

During startup - Warning messages:
1: Setting LC_CTYPE failed, using "C" 
2: Setting LC_COLLATE failed, using "C" 
3: Setting LC_TIME failed, using "C" 
4: Setting LC_MESSAGES failed, using "C" 
5: Setting LC_PAPER failed, using "C" 
6: Setting LC_PAPER failed, using "C" 
7: Setting LC_MEASUREMENT failed, using "C" 
> grDevices::pdf.options(useDingbats = …

在R中,capture.output()可以stdout将表达式中的输出捕获为字符向量,例如

> x = capture.output(print(1:10))
> x
[1] " [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10"

朱莉娅有同等的功能吗？

所以我有一个小插曲,vignettes/test-vignette3.Rmd:

---
title: "Sample Document"
output:
  html_document:
    highlight: kate
    theme: spacelab
    toc: yes
  pdf_document:
    toc: yes
---

Header
=========

当我按下knit HTML按钮时,我得到以下内容:

processing file: test-vignette3.Rmd
output file: test-vignette3.knit.md


Output created: /tmp/RtmpKVpegL/preview-5ef42271c0d5.dir/test-vignette3.html

但是,如果我将此文件复制到inst/doc并按下knit HTML按钮,我会得到:

processing file: test-vignette3.Rmd
output file: test-vignette3.knit.md


Output created: test-vignette3.html

我的问题是:

1. 如何获得RStudio将输出保存从knit HTML上vignettes/test-vignette3.Rmw到小插图目录？
2. test-vignette3.knit.md在knit HTML程序中如何让RStudio不被删除？(我想要.md所以人们可以在我的github回购中阅读.)

我正在运行RStudio版本0.98.836,rmarkdown版本0.1.98和knitr版本1.5.

我不仅希望我的数字出现在我的knitr生成的报告中,而且我还希望将它们输出到单独的文件中.为此,我提供了如下代码:

```{r}
  #Plot figure in report
  plot(x,y)

  #Plot figure in file
  pdf(file="MyFig.pdf")
  plot(x,y)
  dev.off()
```

这很好用,但我希望有一个更优雅的解决方案,已经内置到knitr.是否有一个块选项或类似的东西可以实现相同的结果？

我正在尝试使用此示例将3个文件编织在一起:http://rmarkdown.rstudio.com/rmarkdown_websites.html

我的文件都共享同一目录,该目录已在RStudio构建选项中设置.我用我自己的文件名从示例中复制了YML.即使我直接复制示例,我也会得到同样的错误.

我甚至从RMarkdown Github运行了site_generator函数:https://github.com/rstudio/rmarkdown/blob/master/R/render_site.R#L157

我注意到有自定义生成器的选项,我不想要.我想做的就是能够将几个降价文件编织到一个网页中,然后为每个页面/部分创建一个带有标签的导航栏.

我正在使用rmarkdown生成一个单词(.docx)报告.我想改变toc的标题.这似乎是可能的,pandoc_args因为在doc文件(1)的情况下可以作为yaml头中的选项传递.但我做得不对.有人能提供一个有效的例子吗？

(1)pandoc.args包含在rmarkdown可能的选项中,在pandoc手册中,有一个toc-title选项

---
title: "yaml header"
author: "cedric"
output:  
  word_document:
   toc: true
pandoc_args: toc-title="Table des matières"
---
# One section
# Another

这会产生:

我有一些 R markdown，其中包含以下代码：

```{r huff51, fig.show='hold', fig.cap='Design decisions connecting research purpose and outcomes [@huff_2009_designingresearchpublication p. 86].', echo=FALSE}

knitr::include_graphics('images/Huff-2009-fig5.1.svg')
```

当使用 bookdown 生成 HTML 输出时，一切都按预期进行。

当使用 bookdown 生成 PDF 输出时，我收到一条错误消息! LaTeX Error: Unknown graphics extension: .svg.

这是可以理解的，因为 knitr 使用 Latex\includegraphics{images/Huff-2009-fig5.1.svg}来包含图像。所以，这本身并不是一个错误。

有没有更好的方法来包含 SVG 图像，这样我就不需要将其预处理为 PDF 或 PNG 等图像？