我有一个数据框,其中行索引和列标题应确定每个单元格的内容。我正在使用以下df的更大版本:
df = pd.DataFrame(index = ['afghijklde', 'afghijklmde', 'ade', 'afghilmde', 'amde'],
columns = ['ae', 'azde', 'afgle', 'arlde', 'afghijklbcmde'])
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具体来说,我想应用自定义函数edit_distance()或等效函数(有关函数代码,请参见此处),该函数计算两个字符串之间的差异得分。两个输入是行名和列名。以下工作正常,但速度非常慢:
for seq in df.index:
for seq2 in df.columns:
df.loc[seq, seq2] = edit_distance(seq, seq2)
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这产生了我想要的结果:
ae azde afgle arlde afghijklbcmde
afghijklde 8 7 5 6 3
afghijklmde 9 8 6 7 2
ade 1 1 3 2 10
afghilmde 7 6 4 5 4
amde 2 1 3 2 9
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有什么更好的方法(也许使用applymap()?)呢?一切我已经试过applymap()或apply或df.iterrows()返回的那种错误 …