我想知道igraph中是否有函数来计算加权图中顶点之间的连接概率,其中边的权重是相邻顶点连接的概率.
我已经基于这样的邻接矩阵构建了一个图形,其中相邻连接概率形成权重(这适用于河流网络,因此图的每个节点仅连接到单个下游节点).
我本来希望使用shortest.pathsigraph中的功能,但总和权重而不是计算它们的产品,我无法找到改变它的方法.
下面的示例显示了我如何根据我拥有的数据构建邻接矩阵,即顶点连接到其下游顶点(ProbConn)的概率,然后是下游顶点(下游)的标识.最下游的顶点是河口,因此它与其他顶点无关(因此称为下游的向量以NA开头).
library(igraph)
# vector of probability of connectivity to downstream vertex
ProbConn <- c(0, 1, 0.945881098491627, 0.997349787519144, 0.891475447373691,
0.993221681072185, 0.48071450525165, 0.0292543433507856, 0.0248645581575872,
1, 0.00540807765075205, 0.661465657844344, 0.108524549747512,
0.383311676351655, 0.708853495942148, 0.00150109592270933, 0.463859846404347,
0.0011491165581467, 2.87879700370202e-09, 0.536140153595653,
0.00831752330277812, 0.00185182893416988, 0.0186237313262708,
0.398961560996748, 0.582414707676981, 0.338534342155656, 1, 0.00137024127706289,
0.291146504057852, 1, 0.0743301054564134, 0.0514743607033332,
1, 1)
# the downstream vertex of each node
downstream <- c(NA, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 2, 2, 7, 5, 8, 4, 6, 10, 3, 11, 3, 4, …