小编Max*_*axS的帖子

我是python的新手，并希望使用bio软件包中的entrez系统从pubmed中提取摘要。我得到了电子搜索，以提供我的UID（存储在中my_list_ges），也可以使用efetch下载条目。但是现在，结果是字典列表，条目看起来像字典，但我无法访问它们：

Entrez.email= "my-email@provider.sth"
handle=Entrez.efetch(db="pubmed",id=my_list_ges[0],rettype="null",retmode="xml")
record = Entrez.read(handle)
abstract=record["Abstract"]
handle.close()

结果是TypeError：

TypeError: list indices must be integers, not str 

KeyError当尝试'Abstract'从第一条记录中检索时，我得到一个：

>>> record[0]["Abstract"]
KeyError: 'Abstract'

这很奇怪，因为在电子搜索的结果中，我可以通过字典轻松访问我的UID

record [0]的结构为：

{u'MedlineCitation': DictElement({
        u'OtherID': [],
        u'OtherAbstract': [],
        u'CitationSubset': ['IM'],
        u'KeywordList': [],
        u'DateCreated': {u'Month': '03', u'Day': '17', u'Year': '2016'},
        u'SpaceFlightMission': [],
        u'GeneralNote': [],
        u'Article':
        DictElement({
            u'ArticleDate': [
                DictElement({u'Month': '03', u'Day': '16', u'Year': '2016'}, attributes={u'DateType': u'Electronic'})],
           u'Pagination': {u'MedlinePgn': 'e0151666'},
           u'AuthorList': ListElement([
            DictElement({
                u'LastName': "O'Neill",
                u'Initials': 'KE',
                u'Identifier': [],
                u'AffiliationInfo': [{
                    u'Affiliation': 'MRC …

我想根据相应的字符串（基于字典）在我的绘图 xaxis 中使用不同的颜色显示我的刻度文本。是否有一个功能可以做到这一点，也许是通过 HTML 编码？

 ticktext = ['<font color="red">{}</font> '.format(x) for x in ticktexts]

不起作用，它将 html 字符串提供给标签。

我想将pandas DataFrame的索引用作seaborn的x值，并引发值错误。一个小测试示例：

import pandas as pd
import seaborn as sns
sns.lineplot(x='index',y='test',hue='test2',data=pd.DataFrame({'test':range(9),'test2':range(9)}))

它提出：

ValueError: Could not interpret input 'index'

不能将索引用作x值？我究竟做错了什么？Python 2.7，Seaborn 0.9

使用注释时，我尝试在绘图中为文本添加下划线。我使用添加注释

import plotly.graph_objects as go
g = go.FigureWidget(make_subplots(rows=1,cols=1))
g.update_layout(annotations=[dict(text='my text')]) #plus any other parameters

是否有一个选项（也许在注释字典中？）带有下划线的文本？

谢谢！

我处理数据，对于某些示例，数据是有问题的。Python 提出了一个

ValueError：残差在初始点不是有限的。

是否有可能仅通过消息捕获值错误"Residuals are not finite in the initial point."？我试过：

try:
    [code that could raise the error]
except Exception as e:
    if e=='ValueError(\'Residuals are not finite in the initial point.\')':
        [do stuff I want when the Residuals are not finite]
    else:
        raise e

但它仍然一直引发错误。有没有办法实现我想象的样子？

谢谢

我知道这个主题的变体已经在别处讨论过,但其他线程都没有帮助.

我想将一个字符串从python移交给sql.然而,可能会发生撇号(')出现在字符串中.我想用反斜杠逃脱它们.

sql = "update tf_data set authors=\'"+(', '.join(authors).replace("\'","\\\'"))+"\' where tf_data_id="+str(tf_data_id)+";"

但是,这总是会\\'在我的字符串中给出.因此,反斜杠本身被转义,并且sql语句不起作用.

有人可以帮助我,或者让我替代我这样做的方式吗？谢谢