我有Mac OS 10.9.5.我已经从互联网上下载了一个大的zip文件,所有者为我改为zip64,所以它可以工作.我尝试解压缩文件,unzip SNPsnap_gcan_3_500.zip但我得到以下错误
End-of-central-directory signature not found. Either this file is not
a zipfile, or it constitutes one disk of a multi-part archive. In the
latter case the central directory and zipfile comment will be found on
the last disk(s) of this archive.
unzip: cannot find zipfile directory in one of SNPsnap_gcan_3_500.zip or
SNPsnap_gcan_3_500.zip.zip, and cannot find SNPsnap_gcan_3_500.zip.ZIP, period.
我不知道如何解压缩这个文件.有什么想法吗？
我有df1：
Account Score1 Score2 Score3 Score4 Score5 Score6 Random Random2
23 F30 G1 G5 H10 J18 NULL 3 4
42 NULL NULL NULL NULL NULL NULL 5 6
56 D10 D11 NULL NULL NULL NULL 6 2
59 X14 D3 F4 A11 A12 A13 8 2
41 D11 D12 NULL NULL NULL NULL 7 7
45 C3 C10 R4 T5 NULL NULL 1 1
30 C4 NULL NULL NULL NULL NULL 1 5
33 D2 D3 NULL NULL …我在表单中有一个数据框
Set_1 Set_2 Set_3 Set_4 Set_5 Set_6 Set_7
abc89 abc62 4:5 abc513 abc512 abc81 abc10
abc6 pop abc11 abc4 giant 1:3 abc15
abc90 abc16 abc123 abc33 abc22 abc08 9
11:1 abc15 abc72 abc36 abc57 abc9 abc55
我想将以"abc"开头的任何单元格转换为NA.我还想将任何带有冒号的细胞转变为NA.我希望我的输出是data.frame.如何在R中轻松完成？
我有一个看起来像这样的data.frame:
Input_SNP_CHR Input_SNP_BP Set_1_CHR Set_1_BP Set_2_CHR Set_2_BP Set_3_CHR Set_3_BP
4 184648954 18 71883827 7 135798891 7 91206783
13 34371442 14 52254555 1 223293324 7 54912662
18 71883393 22 50428069 7 138698825 8 97486210
我想在每个CHR列中添加字符串"chr",以使我的输出看起来像:
Input_SNP_CHR Input_SNP_BP Set_1_CHR Set_1_BP Set_2_CHR Set_2_BP Set_3_CHR Set_3_BP
chr4 184648954 chr18 71883827 chr7 135798891 chr7 91206783
chr13 34371442 chr14 52254555 chr1 223293324 chr7 54912662
chr18 71883393 chr22 50428069 chr7 138698825 chr8 97486210
我有一个名为的data.frame df.ordered,如下所示:
labels gvs order color pvals
1 Adygei -2.3321916 1 1 0.914
2 Basque -0.8519079 2 1 0.218
3 French -0.9298674 3 1 0.000
4 Italian -2.8859587 4 1 0.024
5 Orcadian -1.4996229 5 1 0.148
6 Russian -1.5597359 6 1 0.626
7 Sardinian -1.4494841 7 1 0.516
8 Tuscan -2.4279528 8 1 0.420
9 Bedouin -3.1717421 9 2 0.914
10 Druze -0.5058627 10 2 0.220
11 Mozabite -2.6491331 11 2 0.200
12 Palestinian -0.7819299 12 2 0.552 …我有一个 6200 行长的文件，如下所示：
chrom chromStart chromEnd score a a.1
1 chr1 834359 867552 4 0.020979021 0.0000000000
2 chr1 1880283 1940830 9 0.075757576 0.0000000000
3 chr1 1960387 2064958 13 0.115093240 0.0006596306
4 chr1 2206040 2249092 5 0.019230769 0.0000000000
5 chr1 2325759 2408930 11 0.021296885 0.0080355001
我需要将文件分成 1000 行长的文件。如何才能做到这一点？