小编SN2*_*248的帖子

我正在编写一个 r 包，它为libSBMLC库提供了一个包装器。

我使用该rcppgsl 包作为参考，它查找头文件和 GNU 科学库的库文件的位置，GSL并使用该信息编写configure脚本Makevars和Makevars.in. 我目前不是为 Windows 构建。在我的机器（macOS）上，libsbml（SBML C 库）安装在通常的位置，即

头文件位于 - /usr/local/include/sbml

和库文件在 - /usr/local/lib。事实上，如果在我的包Makevars文件中使用以下内容，我可以构建我的包.

CXX=clang++
PKG_CPPFLAGS= -I/usr/local/include
PKG_LIBS= $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS) /usr/local/lib/libsbml-static.a

但是，我想学习如何使用configure脚本来查找库并使用该信息来构建包。configure.acfrom的相关部分rcppgsl是

## Check for non-standard programs: gsl-config(1)
AC_PATH_PROG([GSL_CONFIG], [gsl-config])
## If gsl-config was found, let's use it
if test "${GSL_CONFIG}" != ""; then
    # Use gsl-config for …

与此处提出的问题类似，我尝试在长文档中插入锚点，以便用户可以轻松导航到文档的目录。

我的代码如下：

---
title: "Sample Document"
output:
  html_document:
    toc: true
    theme: united
---
<a id="top"></a>

# First Section

然后我[Go to Top](#top)在想要链接到文档顶部的任何位置添加。

我遇到的问题是，单击 时Go to Top，页面向上滚动，位于First Section顶部，而不是目录（这就是我想要的）。因此用户必须再次向上滚动才能进入目录。

有没有办法滚动回到文档的最顶部，以便在页面上再次看到目录。

我尝试放在<a id="top"></a>之前---，但这不起作用。

任何帮助将非常感激！！谢谢。

我正在尝试Rcpp使用外部库构建一个包含代码的R包.我之前曾问过如何在这里使用外部C库.我遇到的问题是,只要包含以下代码行即可

y = N_VNew_Serial(3);

我收到了错误

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

我没有得到该行的错误

N_Vector y = NULL;

所以,我认为与图书馆的连接工作正常.我还确认函数声明N_VNewSerial()是在nvector/nvector_serial.h你需要查看整个包代码的情况下,它可以在这里找到

特定Rcpp文件的代码粘贴如下

#include <Rcpp.h>

// #include <iostream.h>
#include <cvode/cvode.h>               /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include <nvector/nvector_serial.h>    /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include <cvode/cvode_dense.h>         /* prototype for CVDense */
#include <sundials/sundials_dense.h>   /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */ …

我最近发布了一个关于我blogdown的网站部署的问题.我并没有完全按照blogdown书中的说明进行操作,但我解决了问题 - 感谢Yihui的回答.

我正在尝试按照文档中的说明完全加载我的网站.所以,我现在在我的git repo中有整个项目,我正在使用netlify文档中提到的选项,即在部署设置中Build command:设置为hugo,Publish directory:设置为public和HUGO_VERSION设置的0.30选项.

我正在成功部署(in netlify)并且网站显示正常

https://typesetter-signs-43683.netlify.com/

但是,我的早期网址(来自github页面)

https://sn248.github.io/

显示404,file not found误差.

netlify没有给出任何部署错误,github页面设置说明了这一点site is published.我得到了主题的图标,但没有别的,我发现这非常令人困惑!

我怀疑,还有另一个我失踪的关键步骤.这里的任何指针都会非常有用!

谢谢,SN248

我正在尝试将我的第一个包提交到CRAN我的机器上,我在运行时收到以下警告R CMD check(通过RStudio)

checking compilation flags used ... WARNING
Compilation used the following non-portable flag(s):
  ‘-Wno-unused-function’ ‘-Wno-unused-variable’
including flag(s) suppressing warnings
R CMD check results
0 errors | 1 warning  | 0 notes

R CMD check succeeded

在Rwin-builder 上构建我的包时,我没有收到此警告.我确实NOTE从win-builder服务中得到了一个,但我认为这是因为这是第一次提交并且有拼写CRAN无法识别,即

* checking CRAN incoming feasibility ... NOTE

New submission

Possibly mis-spelled words in DESCRIPTION:
  CVODE (8:167)
  CVODES (8:219)
  Livermore (8:108)

我并不那么担心第一次提交和错误拼写的单词,因为我可以在评论(和cran-comments.md文件)中解释它们.但有没有办法删除我在我的系统上的警告(macOS,R = 3.5.0).该软件包构建良好的 …

我正在使用 Rmarkdown 生成 HTML 报告，其中我希望用户可以选择在每个部分或图形之前查看代码（当他们需要时使用切换显示/隐藏代码）。

我想知道是否有一个选项可以为每个代码块全局和单独地这样做。

我看过一些以前使用 javascript 的解决方案，但我不熟悉该语言。我希望我可以在 Rmarkdown 中选择一个选项。

此处和此处显示了以前使用 javascript 的方法，但我不确定如何将这些方法包含在我的 Rmarkdown 文件中。我尝试了以下方法，但没有奏效

<script src="toggleR.js"></script> 
```{r}
summary(cars)
```

Rmarkdown 中的一个工作示例将非常有帮助！！

谢谢

我正努力scale_color_manual()工作ggplot2而且我没有得到颜色.

我在这个链接上关注这个例子

我的数据集由.df给出

structure(list(cond = structure(1:3, .Label = c("A", "B", "C"
), class = "factor"), yval = c(2, 2.5, 1.6)), .Names = c("cond", 
"yval"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -3L))

如果我使用示例中的代码来制作条形图,它就可以工作

ggplot(df, aes(x=cond, y=yval, fill=cond)) + geom_bar(stat="identity") + 
    scale_fill_manual(values=c("red", "blue", "green"))

我更改了代码以制作散点图,我现在看不到颜色的点.

ggplot(df, aes(x=cond, y=yval)) + geom_point() + 
    scale_color_manual(values=c("red", "blue", "green"))

这可能是微不足道的,但我很难找到我在这里做错了什么.

任何帮助将非常感激!!

谢谢

我正在尝试开发一个R包,它使用Sundials C库来求解微分方程.为了不让用户安装库,我将库的源代码放在我的包中.

我已将库中的所有头文件/inst/include/sundials-2.6.2和我的包文件夹中的.c文件放入src/sundials-2.6.2.

从我对这个主题的SO帖子的阅读,sourceCpp多个文件中的代码(例如,如果它们被构造成包的一部分,则单独.h和.cpp文件应该有用.我试图从Sundials包中运行示例代码文件

我的代码(只是开头部分)看起来像

#include <Rcpp.h>

#include "../inst/include/sundials-2.6.2/cvode/cvode.h"             /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include "../inst/include/sundials-2.6.2/nvector/nvector_serial.h"  /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include "../inst/include/sundials-2.6.2/cvode/cvode_dense.h"      /* prototype for CVDense */
#include "../inst/include/sundials-2.6.2/sundials/sundials_dense.h" /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */
#include "../inst/include/sundials-2.6.2/sundials/sundials_types.h" /* definition of type realtype */

但是,我收到了一个错误

fatal error: sundials/sundials_nvector.h: No such file or directory

我在以下github存储库中做了类似的例子

Rcppsundials - https://github.com/AleMorales/RcppSundials.R/blob/master/src/cvode.cpp

使用调用头文件

#include <cvodes/cvodes.h>           // CVODES functions and …

我试图找到一种更简单的方法来计算使用dplyr. 我的玩具数据集是这样的

structure(list(CAR = structure(c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 1L, 
2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L), .Label = c("a", 
"b", "c", "d", "e", "f"), class = "factor"), TIME = c(0L, 0L, 
0L, 0L, 0L, 0L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L
), VAR = c(20L, 30L, 40L, 50L, 60L, 70L, 30L, 40L, 50L, 60L, 
70L, 80L, 40L, 50L, 60L, 70L, 80L, 90L)), .Names = c("CAR", "TIME", …

我正在使用bookdownR 中的包编写 gitbook，但我不希望最终的书有 facebook、twitter 的共享链接。我正在使用类似的东西YAML

--- 
title: "A Minimal Book Example"
author: "SN"
date: "`r Sys.Date()`"
output: 
  bookdown::gitbook
    gitbook_config:
      sharing:
        facebook: false
        twitter: false
documentclass: book
link-citations: yes
description: "This book ... ."
---

但我收到错误

Error in yaml::yaml.load(enc2utf8(string), ...) : 
  Scanner error: mapping values are not allowed in this context at line 6, column 19
Calls: <Anonymous> ... yaml_load_utf8 -> mark_utf8 -> <Anonymous> -> .Call
Execution halted

谁能帮助我设置选项，YAML以便最终渲染中不会显示共享选项？

谢谢！序列号