我正在尝试编写调用以下cython函数test1的python代码,如下所示:
def test1( np.ndarray[np.int32_t, ndim=2] ndk,
np.ndarray[np.int32_t, ndim=2] nkw,
np.ndarray[np.float64_t, ndim=2] phi):
for _ in xrange(int(1e5)):
test2(ndk, nkw, phi)
cdef int test2(np.ndarray[np.int32_t, ndim=2] ndk,
np.ndarray[np.int32_t, ndim=2] nkw,
np.ndarray[np.float64_t, ndim=2] phi):
return 1
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我的纯python代码将调用test1并传递3个numpy数组作为参数,它们非常大(大约10 ^ 4*10 ^ 3).test1将依次调用使用cdef关键字定义的test2 并传递这些数组.由于test1需要在返回之前多次调用test2(大约10 ^ 5),并且不需要在cython代码之外调用test2,我使用cdef而不是def.
但问题是,每次test1调用test2时,内存开始稳定增加.我试图gc.collect()在这个cython代码之外调用,但它不起作用.最后,程序将被系统杀死,因为它消耗了所有的记忆.我注意到这个问题只发生在cdef和cpdef函数中,如果我将其更改为def,它可以正常工作.
我认为test1应该将这些数组的引用传递给test2而不是对象.但似乎它创建了这些数组的新对象并将它们传递给test2,之后这些对象永远不会被python gc触及.
我错过了什么?