小编Qui*_*uim的帖子

我正在使用带有Torque/Maui系统的集群.我有一个使用qsub命令提交一个作业的bash脚本,然后做了几件事,比如移动文件,写ASCII文件,并检查我提交的作业的输出.关于此输出,基本上,如果它包含数字1,则需要再次提交作业.如果不同于1,则bash脚本会执行其他操作.

问题是qsub在后台运行,并且所有bash都会立即进行评估.我想强迫qsub表现得非常像awk,cat,sort等...当脚本在这些命令完成后进一步发展 - 如果没有放在后台.

所以,我需要在第一个qsub上停止bash,并在qsub完成后继续运行,这意味着,当作业完成时.有没有办法做到这一点？它将类似于:

   -sync y    # in the SGE system, for instance.

是)我有的:

#!/bin/bash
.
.
some commands
.
.
qsub my_application  # need to wait until my_application get done
.
.
more commands
.
.
my_application_output=(`cat my_application_output.txt`)

case "$my_application_output" in
["1"])
     qsub my_application
     ;;
["0"])
     some commands
     ;;
["100"])
     some commands
     ;;
*)
     some commands
     exit 1

esac

.
.

一些言论

• 使用时不方便:qsub -I -x,一旦我想将输出保留在输出文件上; 并且不希望通过启动交互模式锁定节点(-I)
• 我想这不是一个简单的工作依赖问题,一旦重新提交1)可能发生,2)不能,而且,最重要的是,如果发生(1),它可能是几次.

谢谢大家

我需要读取coordinates.ascii只有一行的ASCII文件:

-I0.00130000258937/0.000899999864241

一个bash脚本里面,属性0.00130000258937的变量x_inc并0.000899999864241给y_inc.猜猜正则表达式x_inc是:

(\d.\d+)(?=/)

但我不知道y_inc的正则表达式以及sed或grep命令/语法在bash中实现regexp ..

x_inc=$(sed -n '(\d.\d+)(?=/)' coordinates.ascii )     # does not work!!!