小编How*_*man的帖子

我正在尝试构建一个简单的工作流程来将参数列表提供给脚本。为了显示：

SAMPLES=['A','B']

rule test:
    params:
        sample=expand("{sample}", sample=SAMPLES)
    script:
        "test.py {params.sample}"

但是，snakemake 只执行带有 sample 的脚本A，而不是B. 换句话说，我相信它正在执行python test.py A B，而不是python test.py A然后python test.py B。同样，我认为这可以通过以下方式说明：

SAMPLES=['A','B']

rule print_samples:
    params:
        sample=expand("{sample}", sample=SAMPLES)
    script:
        "echo {params.sample} \n"

我希望看到A并B打印在不同的行上，但它打印A B在同一行上。

我是否遗漏了扩展与参数一起工作的方式？理想情况下，我想添加-j标志以并行运行它们（目前-j只是A单独执行）。