小编Fri*_*ede的帖子

我目前正在使用 R 开发一个生物信息学项目，在尝试使用该包时遇到错误biomaRt。安装包并将其加载到 R 中后，我尝试选择一个biomaRt数据库用于我的分析。

这是我收到错误时运行的代码：

library(biomaRt)\nensembl <- useEnsembl(biomart = "ensembl", dataset = "hsapiens_gene_ensembl")\n

错误信息：

Error in `collect()`:\n! Failed to collect lazy table.\nCaused by error in `db_collect()`:\n! Arguments in `...` must be used.\n\xe2\x9c\x96 Problematic argument:\n\xe2\x80\xa2 ..1 = Inf\n\xe2\x84\xb9 Did you misspell an argument name?\n\nBacktrace:\n     \xe2\x96\x86\n  1. \xe2\x94\x9c\xe2\x94\x80biomaRt::useEnsembl(biomart = "genes", dataset = "hsapiens_gene_ensembl")\n  2. \xe2\x94\x82 \xe2\x94\x94\xe2\x94\x80biomaRt:::.getEnsemblSSL()\n  3. \xe2\x94\x82   \xe2\x94\x94\xe2\x94\x80BiocFileCache::BiocFileCache(cache, ask = FALSE)\n  4. \xe2\x94\x82     \xe2\x94\x94\xe2\x94\x80BiocFileCache:::.sql_create_db(bfc)\n  5. \xe2\x94\x82       \xe2\x94\x94\xe2\x94\x80BiocFileCache:::.sql_validate_version(bfc)\n  6. \xe2\x94\x82         \xe2\x94\x94\xe2\x94\x80BiocFileCache:::.sql_schema_version(bfc)\n  7. \xe2\x94\x82 …