您好(这是我的第一条消息,所以如果有什么不对的地方,我很抱歉),
我已经有这个问题几天了。我无法安装新包,我读过一个类似的问题,但就我而言,问题仅在我尝试安装新的Bioconductor包时(或当我删除旧包并尝试重新安装时)发生。问题是我总是得到下一条消息的一些变化(在这个例子中我试图安装 ComplexHeatmap):
BiocManager::install("ComplexHeatmap")
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
Bioconductor version 3.12 (BiocManager 1.30.13), R 4.0.0 (2020-04-24) 安装包'BiocVersion', 'ComplexHeatmap' 也安装依赖项 ?shape?, ?rjson?, ?BiocGenerics?, ? circlize?、?GetoptLong?、?colorspace?、?线索?、?RColorBrewer?、?GlobalOptions?、?png?、?Cairo?、?S4Vectors?、?IRanges?、?matrixStats?
无法打开 URL
'https://bioconductor.org/packages/3.12/data/annotation/bin/windows/contrib/4.0/PACKAGES.rds':HTTP 状态为 '404 Not Found'Old packages: 'installr', 'boot ', 'class', 'cluster', 'codetools', 'foreign', 'KernSmooth', 'lattice', 'MASS', 'Matrix', 'mgcv', 'nlme', 'nnet', 'spatial', “生存”更新全部/部分/无?[a/s/n]:更新全部/部分/无?[a/s/n]:
它告诉我我必须安装 X 包,所以我输入“a”,然后发生了这种情况:
readRDS(dest) 中的错误:从连接读取错误
第一次尝试后,我只收到第二条消息,直到我重新启动 R。
我试过了:
我尝试安装以前版本的 BiocManager,但无法安装。一切都在更新。非常感谢您的关注,感谢您的帮助。