如何将此VCF 数据转换为 pandas 数据框?
注意:复制问题不需要完整文件。只需前 50 行(上面要点链接的第一部分)就可以了。理想情况下,我希望采用以下形式:
到目前为止,我只能获取标题:
import pandas as pd
f = open('clinvar_final.txt',"r")
for line in f.readlines():
if line[:5] == 'CHROM':
vcf_header = line.strip().split('\t')
df = pd.DataFrame
df.header = vcf_header
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