标签: vectorization

如何向量化多维矩阵的 Softmax 概率

我正在尝试完成斯坦福 cs244n 课程的作业 1。问题 1b 强烈推荐对 Softmax 函数进行优化。我设法得到了 N 维向量的 Softmax。我还得到了 MxN 维矩阵的 Softmax,但在列中使用了 for 循环。我有以下代码:

def softmax(x):
    orig_shape = x.shape

    # Matrix
    if len(x.shape) > 1:
        softmax = np.zeros(orig_shape)
        for i,col in enumerate(x):
            softmax[i] = np.exp(col - np.max(col))/np.sum(np.exp(col - np.max(col)))
    # Vector
    else:
        softmax = np.exp(x - np.max(x))/np.sum(np.exp(x - np.max(x)))
    return softmax
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我可以实现更优化的 Matrix 实现吗?

python performance numpy vectorization softmax

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特征缩放的矢量化

我想用 2 列缩放矩阵 (X)。我正在使用均值归一化,并在 Octave 中写了以下几行:

X_norm = X
mu = mean(X);
sigma = std(X);
X_norm(:,1) = (X_norm(:,1) .- mu(:,1)) ./ sigma(:,1);
X_norm(:,2) = (X_norm(:,2) .- mu(:,2)) ./ sigma(:,2); 
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你能告诉我一种更简洁的方法来矢量化这些计算吗?

我通过与结果进行比较来检查我的代码zscore(X)并且它们匹配 - 即sum(X_norm - zscore(X))返回了我 0 0。

我被限制不使用zscore(),因此问题。

样本数据如下:

2104      3
1600      3
2400      3
1416      2
3000      4
1985      4
1534      3
1427      3
1380      3
1494      3
1940      4
2000      3
1890      3
4478      5
1268      3
2300      4
1320      2
1236 …
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vectorization octave

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R dplyr::mutate with ifelse 以全局变量为条件从第一行回收结果

我很好奇为什么ifelse()调用中的语句dplyr::mutate()似乎只适用于我的数据框的第一行。这将返回一个值,该值在整个列中循环使用。由于在这两种情况下评估的表达式ifelse()仅在我的数据框上下文中有效,我希望条件检查和结果表达式评估作为一个整体对列执行,而不仅仅是它们的第一个元素。

这是一个例子:我在数据框外定义了一个名为checkVar. 根据 的值checkVar,我想将不同的值添加到新列 中的数据框中z,这些值是作为现有列的函数计算的。

如果我做

checkVar <- 1
df <- data.frame( x=11:15, y=1:5 ) %>%
  dplyr::mutate( z=ifelse(checkVar == 1, x/y, x-y) )
df
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它返回

   x y  z
1 11 1 11
2 12 2 11
3 13 3 11
4 14 4 11
5 15 5 11
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z 不是每行的 x 和 y 的商,而是所有行都填充有来自数据帧第一行的 x 和 y 的商。

但是,如果我指定rowwise(),我会得到我想要的结果:

df <- df %>%
  dplyr::rowwise() %>%
  dplyr::mutate( …
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conditional r vectorization dplyr mutate

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如何加速熊猫字符串函数?

我正在使用 Pandas 向量化 str.split() 方法来提取从“~”上的拆分​​返回的第一个元素。我还尝试将 df.apply() 与 lambda 和 str.split() 一起使用来产生等效的结果。使用 %timeit 时,我发现 df.apply() 的执行速度比矢量化版本快。

我读到的关于矢量化的所有内容似乎都表明第一个版本应该有更好的性能。有人可以解释为什么我得到这些结果吗?例子:


     id     facility      
0   3466     abc~24353  
1   4853     facility1~3.4.5.6   
2   4582     53434_Facility~34432~cde   
3   9972     facility2~FACILITY2~343
4   2356     Test~23 ~FAC1  
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上面的数据框有大约 500,000 行,我也测试了大约 100 万行,结果相似。以下是一些示例输入和输出:

矢量化


     id     facility      
0   3466     abc~24353  
1   4853     facility1~3.4.5.6   
2   4582     53434_Facility~34432~cde   
3   9972     facility2~FACILITY2~343
4   2356     Test~23 ~FAC1  
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Lambda 应用

In [1]: %timeit df['facility'] = df['facility'].str.split('~').str[0]
1.1 s ± 54.4 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, …
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python string split vectorization pandas

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在 Numpy 中逐像素迭代两个图像(使用随机条件)

import random
def sp_noise(image,prob):
    '''
    Add salt and pepper noise to image
    prob: Probability of the noise
    '''
    output = np.zeros(image.shape,np.uint8)
    thres = 1 - prob 
    for i in range(image.shape[0]):
        for j in range(image.shape[1]):
            rdn = random.random()
            if rdn < prob:
                output[i][j] = 0
            elif rdn > thres:
                output[i][j] = 255
            else:
                output[i][j] = image[i][j]
    return output
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这就是我想要达到的目标。我知道此函数不使用矢量化,但我不知道在这种情况下如何摆脱循环。如果有像素值的条件,那将是微不足道的。但在这种情况下,索引或像素值没有条件,我只需要保留像素值,或者根据随机变量的值将其设置为 0 或 1。

我如何矢量化?

python numpy image-processing vectorization

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具有 3D 向量的两个 numpy 数组的点积

我的目标是找到最接近单个点的段(在段数组中)。获取 2D 坐标数组之间的点积有效,但使用 3D 坐标会出现以下错误:

*ValueError: matmul: Input operand 1 has a mismatch in its core dimension 0, with gufunc signature (n?,k),(k,m?)->(n?,m?) (size 2 is different from 3)*


A = np.array([[1,1,1],[2,2,2]])
B = np.array([[3,3,3], [4,4,4]])

dp = np.dot(A,B)
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dp应该返回2个值的点积[1,1,1]@[3,3,3][2,2,2]@[4,4,4]

// 谢谢大家。

这是找到最接近单个点的线段的最终解决方案。
欢迎任何优化。

import numpy as np
import time

#find closest segment to single point

then = time.time()

#random line segment
l1 = np.random.rand(1000000, 3)*10   
l2 = np.random.rand(1000000, 3)*10

#single point
p = np.array([5,5,5]) #only single …
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python arrays numpy vectorization dot-product

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是否有一个内在函数可以将 __m128i 向量的最后 n 个字节归零?

鉴于n,我想将向量的最后一个n字节归零__m128i

例如,考虑以下__m128i向量:

11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111

将最后一个n = 4字节归零后,向量应如下所示:

11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 11111111 00000000 00000000 00000000 00000000

是否有执行此操作的 SSE 内在函数(通过接受__128i向量和n作为参数)?

c sse simd vectorization

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重复值 n 次,n 在一个数组中

我有一个a值数组,其值在每个索引处idx我想重复一定b[idx]次数,idx在另一个数组 ( b)中的相同索引处给出,如下所示:

a = numpy.array([1, 2, 3 ,4, 5])
b = numpy.array([2, 3, 1, 2, 4])
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期望的输出:

c = numpy.array([1, 1, 2, 2, 2, 3, 4, 4, 5, 5, 5, 5])
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我意识到我可以做这样的事情:

len_a = numpy.shape(a)[0]
sum_b = sum(b)
c = numpy.zeros((1, 0))
for idx in range(len_a):
    repeated_a = numpy.repeat(a[idx], b[idx])
    repeated_a = numpy.reshape(repeated_a, (1, numpy.shape(repeated_a)[0]))
    c = numpy.hstack((c, repeated_a))
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但是,循环不是一个好的选择,因为它很慢。 我将如何让这个更快?也许某种形式的矢量化。

python numpy vectorization

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如何在 r 中编写一个函数来对记录进行计算?

在 C# 中,我习惯了数据集和当前记录的概念。对我来说,用当前记录的条件编写一个复杂的计算价格函数会很容易。

我无法理解如何在 r 中执行此操作。

我尝试了以下

   train <- read.csv("Train.csv" )
   df <- as.data.frame.matrix(train)
   v = c(  df$Fuel.Type ,df$No.Gears)
   names(v ) <- c( "FuelType" ,"NoGears")
   df$FEType = FEType( v)
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其中 my 函数定义为

FEType <- function(v    ){
  ret="Low"
  if (v["FuelType"]=='G') {
    ret ="High"
  }
  return(ret)
}
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这不像我预期的那样工作,当我检查 v 时,我看到它包含汇总总数而不是我预期的当前行。

我哪里错了?

这里的问题中我在最后一段中看到了一些提示。

为了重现问题,表明我想做什么,我有

IsPretty <-function(PetalWidth){
  if (PetalWidth  >0.3) return("Y")
  return("N")
}

df <- iris
df$Pretty = IsPretty(df$Petal.Width)
    
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这给出了错误

条件的长度 > 1 并且只使用第一个元素

这让我开始研究向量。但我不相信这是正确的方向。

[更新]

我习惯于考虑表格和当前记录。因此我在想

df$Pretty = IsPretty(df$Petal.Width) …
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if-statement r vectorization

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在 Julia 中安装 Devectorize 包的问题

我想在 Julia 中安装devectorize 包,但我遇到了问题。我跑

(@v1.5) pkg> add Devectorize
ERROR: The following package names could not be resolved:
* Devectorize (not found in project, manifest or registry)
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我也试过

Pkg.add("Devectorize")
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同样的结果。不再支持 Devectorize 吗?

vectorization package julia

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