标签: rstudio-server

我在AWS"Ubuntu Server 12.04.2 LTS"上运行R Studio并通过我的浏览器访问R Studio.

当我尝试使用ROAuth包含代码的包在Twitter API上进行身份验证时:

credential<-OAuthFactory$new(consumerKey="xxxxx",
                             consumerSecret="xxxxx",
                             requestURL="https://api.twitter.com/oauth/request_token",
                             accessURL="https://api.twitter.com/oauth/access_token",
                             authURL="https://api.twitter.com/oauth/authorize")

credential$handshake()
registerTwitterOAuth(credential)

之后我得到一个错误registerTwitterOAuth(credential)说法

  Error in registerTwitterOAuth(credential) : 
  ROAuth is no longer used in favor of httr, please see ?setup_twitter_oauth

但是我找不到任何进一步的解释..

我是R的新手,我决定将R放在我拥有的机器上,看看我是否可以远程运行台式机上的代码.

在搜索"怎么做"时,我遇到了"Rserve"和"RStudio"的名字.据我所知,RServe是一个包(实际上,这似乎是在包),我可以用它来配置服务器,而RStudio是IDE.

我的问题是:RStudio"引擎盖下"使用RServe吗？而且,如果没有,那么RStudio与RServe相比如何呢？(即,哪一个更好,为什么？)

[我发现这个问题可能是重复的,但我找不到任何类似的问题]

有没有办法在我的机器上本地运行RStudio,但使用运行R作为引擎而不是本地R安装的远程机器？

为了清楚起见,我知道有可能将RStudio服务器与Web GUI一起使用,但我问的是不同的东西.我想使用连接到运行R的远程机器的本地RStudio应用程序(可能通过ssh).

可能吗？

我在Ubuntu 12.04.4 LTS上有一个RStudio Server(0.98.945)的实例.我升级到这个新功能的最新版本,应该允许您在IDE中运行Shiny应用程序.在桌面版本上,这意味着RStudio在应用程序中打开一个新的RStudio窗口,而在此之前它将在您的默认Web浏览器中打开一个新窗口; 在以前版本的Server版本中,如果您尝试了此操作,则会在浏览器中打开一个失败连接的选项卡.

使用RStudio Server(0.98.945),我正在获得桌面体验的一半,当我运行一个例子时:

library(shiny)
runExample("01_hello") 
# this will open a pop-up window that has some content, but closes immediately
runExample("01_hello", launch.browser=interactive())
# this will open a window in a new tab that does not close, but does not
# load any of the shiny.js elements

我得到的东西,但不是一个工作的闪亮应用程序.

我无法发布截图bc我没有声望,但基本上应用程序是"直方图"示例.所有HTML元素似乎加载正常,控件小部件加载(bin宽度调整器),但直方图的实际图像不加载.此外,整个头部div具有这种灰色色调.

在Chrome检查器中,控制台错误似乎表明此处发生了什么:

WebSocket connection to 'wss://my.company.com/p/3975/websocket/' failed: Error during WebSocket handshake: Unexpected response code: 404.

引用的资源是shiny.js.

这两个链接是我能找到的最接近类似问题的链接,但并不完全正确.没有令人满意的解决方案:

Rstudio和闪亮的服务器代理设置

Websocket - WebSocket握手期间出错:意外的响应代码:404

编辑:我刚刚注意到Chrome检查器中的错误引用了一个名为的连接wss://my.company.com/.这让我想起如果不更改某个隐藏配置文件中的默认值,可能会发生的事情.有谁知道标准Web服务器堆栈的哪个部分会引发这种错误？

我无法从 R Studio 推送，并且不断收到错误消息：

错误：RPC 失败；curl 55 请求的 URL 返回错误：401

致命：远端意外挂断

致命：远端意外挂断

一切都是最新的

突然 ggplot 开始导致错误并冻结我的基本系统重新启动给了我以下信息：“R 会话错误”，“由于意外崩溃，上一个 R 会话异常终止”

我正在使用 RStudio 服务器

为了解决这个问题，我创建了一个新的 VM（windows 10 上的 ubuntu 20.04）升级到 R studio 版本 1.4.1106 我已经升级到 R 4.1 并安装了新的包（tidyverse），这对工作至关重要，但仍然得到一个碰撞。

下面是一个非常简单的测试脚本，失败并出现上面提到的错误 如前所述，这是全新安装

测试脚本

library(tidyverse)
data(iris)
ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Petal.Length, colour=Species)) +
  geom_point()

使用我的用户名和密码登录 Rstudio Server 时，我收到以下信息

Rstudio Initilization Error 
unable to connect to service

我通过以下方式安装了 Rstudio Server：

apt-get install gdebi-core r-base r-base-dev 
wget -c https://download2.rstudio.org/rstudio-server-0.99.489-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-0.99.489-amd64.deb

sudo usermod -a -G rstudio lorencm
sudo service rstudio-server start

id  lorencm
uid=1000(lorencm) gid=1000(lorencm) groups=1000(lorencm),4(adm),24(cdrom),27(sudo),30(dip),46(plugdev),108(lpadmin),111(sambashare),999(docker),1001(rstudio)

我做错了什么？

我经常在 R 服务器环境中工作。但是，每当在最后一个工作日之后回到我的工作中时，系统经常会卡在“恢复 r 会话”中。这可能需要 5-15 分钟以上。我尝试终止 R 或重新启动 R，但通常这并没有真正做任何事情。

我正在寻找一种解决方法，因为转到 R 服务器 URL 并且必须永远等待才能再次启动非常令人沮丧。理想情况下，我可以在我离开的地方继续。但是，如果不能做到这一点，我想也可以……

我在查看文件夹结构时注意到有一个名为“Suspended-R-Session”的文件夹。

在这个文件夹中有一些文件，例如：

• '选项'，
• '库路径'，
• '历史'，
• '环境变量'，
• '环境'，

• 和“设置”。

  我应该删除这些文件以加快加载时间吗？？？

我在具有 64 GB RAM 的 Linux 服务器上通过 Rstudio 服务器运行 h2o。当我初始化集群时，它说总集群内存只有 9.78 GB。我尝试使用 max_mem_size 参数，但仍然只使用 9.78 GB。

localH2O <<- h2o.init(ip =  "localhost", port = 54321, nthreads = -1, max_mem_size = "25g")
H2O is not running yet, starting it now...
java version "1.8.0_131"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_131-b11)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.131-b11, mixed mode)
    Connection successful!
    R is connected to the H2O cluster: 
        H2O cluster uptime:         5 hours 10 minutes 
        H2O cluster version:        3.10.4.6 
        H2O cluster version age: …

关于如何从 docker 容器内部寻址本地文件夹，有很多很少有人投票的问题，但我找不到一个与我的完全匹配的问题，所以这里有另一个：

如何运行 docker 容器并挂载本地文件夹，以便 R/RStudio 可以在容器内访问它？

这听起来有点像：在 Rstudio docker 中挂载本地主目录？并使用类似的方法，我可以启动一个容器并安装一个卷：

docker run -d -p 8787:8787 -v $HOME/my_folder:/LOOKATMEEE -e ROOT=TRUE rocker/tidyverse:3.4

如果我在容器中运行 bash shell，我可以看到文件夹：

docker exec -it 38b2d6ca427f bash

> ls
bin   dev  home  lib    LOOKATMEEE  mnt  proc  run   srv  tmp  var  boot  etc  init  lib64  media       opt  root  sbin  sys  usr
#                       ^ there is is!

但是，如果我在 连接到 RStudio 服务器localhost:8787，则在文件窗格中看不到它，list.files()在 R 控制台中运行时也看不到它：

我确定我错过了一些基本的东西，但如果有人能告诉我那是什么......谢谢！