标签: devtools

install_github是否以递归方式安装依赖项?

R包devtools似乎是使用该install_github()函数直接从其github存储库安装R包的首选方法.

这样做时,不仅安装了已解决的github-package,还安装了直接的CRAN依赖项,即包的Description/Namespace文件中定义的Depends和Imports.

但是,我想知道是否需要间接需要的包,例如Depends和Imports包所需的包,也会自动安装.

例如,在安装DT包通过时install_github("rstudio/DT"),htmltools也会安装(设置dependencies=TRUE)Imports包,但不Rcpp包括前者所依赖的包(R 3.3.1,Rtools34,Win10,x64).这些包需要以另一种方式安装吗?

r devtools

8
推荐指数
1
解决办法
1669
查看次数

听取console.log

我想设置一个监听器console.log()并对消息执行某些操作,而不会阻止默认行为.因此,开发工具的控制台也应该得到消息.有任何想法吗?

javascript console logging devtools

7
推荐指数
1
解决办法
4590
查看次数

运算符重载在R包中停止工作

我有一个基本上是列表的容器类.因为我想支持子集化,所以我重载了子集[运算符(可能实现得很差).

#' Constructor for spectra object
.spectra = function(n_spectrum = 0) {
    object        = vector(mode = "list", n_spectrum)
    class(object) = "spectra"
    return(object)
}

#' Operator overload
#' @export
`[.spectra` = function(x, i) {
    x = unclass(x)
    x = x[i]                  # Using the list's subset function
    class(x) = "spectra"
    return(x)                 # Should return a "spectra" object, not a list
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

现在,这在我的开发环境中(当我正在调试包时)按预期工作.也就是说,如果y_old是一个spectra对象,我做的y_new = y_old[-1],y_new仍然是一个spectra对象.

但是,当我将项目编译为包并安装它时,子集操作符返回一个list而不是一个spectra …

overloading r devtools r-s3

7
推荐指数
1
解决办法
278
查看次数

Devtools文件抛出错误

我正在整理一个R数据包,直到现在我一直在记录数据集.以下内容包含在名为package repo文件夹中charges_ay.RR文件中.

#' Student Charges for Academic Year programs.
#'
#' For more information, download a data dictionary from the IPEDS website.
#' 
#' Survey years 2002 - 2014.
#'
#' @source http://nces.ed.gov/ipeds/datacenter/DataFiles.aspx
#' @format Data frame with columns
"charges_ay"
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

当我尝试devtools::document从包的基础运行时(就像我对其他文件一样),我收到以下错误:

> devtools::document()
Updating ripeds documentation
Loading ripeds
Error: 'charges_ay' is not an exported object from 'namespace:ripeds'
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

鉴于到目前为止一切工作正常,我有点困惑,因为进程和文件文档都是一样的.

任何帮助将不胜感激!

r devtools

7
推荐指数
1
解决办法
534
查看次数

包具有VignetteBuilder字段,但没有预先构建的晕影索引

我正在向CRAN提交一份包裹,我收到了审核小组的以下警告:

包具有VignetteBuilder字段,但没有预先构建的晕影索引.

事实上我在跑步时也看到过devtools::release().我正在使用上一个R版本,R version 3.3.1并具有以下.Rmd插图来源:

---
date: "`r Sys.Date()`"
output: rmarkdown::html_vignette
vignette: >
  %\VignetteIndexEntry{<my vignette title>} 
  %\VignetteEngine{knitr::knitr}
  %\usepackage[utf8]{inputenc}
--- 
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

此外,我已按默认方式包含knitrDESCRIPTION文件中:

Suggests:
    knitr
VignetteBuilder:
    knitr
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我环顾四周,虽然问题似乎很常见,但我还是无法理解索引为什么不构建(以及如何强制构建它).


这个问题和其中的链接是谷歌的顶级结果,但没有解决问题.

vignette r devtools package cran

7
推荐指数
1
解决办法
804
查看次数

test在devtools :: check中失败但是在devtools :: test中工作

有没有办法重现使用的环境devtools::check

我有问题,我的测试工作devtools::test()但内部失败devtools::check().我的问题是现在,如何找到问题.报告check只是打印错误日志的最后几行,我找不到完整的测试报告.

checking tests ... ERROR
Running the tests in ‘tests/testthat.R’ failed.
Last 13 lines of output:
...
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

我知道check使用不同的环境相比,test但我不知道如何调试这些问题,因为它们根本不可重现.特别是这些测试在几个月前运行,所以不知道在哪里寻找问题.

编辑

实际上我试图找到我的问题,我找到了解决方案.但要发布我的解决方案,我必须添加更多细节.

所以我的测试总是失败,因为我测试了markdown脚本,如果它运行没有错误,之后我检查是否正确设置了一些环境变量.这些是我用脚本计算的结果以及我设置的标准设置.因此,如果我在开发后忘记更改某些设置,我想收到警告...

无论如何,既然是降价剧本,我不得不提取代码,我是用这个职位评论knitr:运行Rmarkdown文档中的所有数据块使用knitr::purl,以获取代码,并sys.source执行它.

runAllChunks <- function(rmd, envir=globalenv()){
  # as found here https://stackoverflow.com/questions/24753969
  tempR <- tempfile(tmpdir = '.', fileext = ".R")
  on.exit(unlink(tempR))
  knitr::purl(rmd, output=tempR, quiet=TRUE)
  sys.source(tempR, envir=envir)
}
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

出于某种原因,这会产生一个错误,因为可能会持续几周(不确定我最近安装了哪些新软件包......).但是由于有一个新的评论,我可以使用knitr::knit它也执行代码,这按预期工作,现在我的测试不再抱怨.

所以最后,我不知道问题究竟在哪里,但现在正在发挥作用.

r devtools testthat

7
推荐指数
1
解决办法
639
查看次数

在RStudio中构建和重新加载会生成"保存文件"错误

我正在使用支持Rcpp的R软件包作为RStudio(版本1.0.136,Ubuntu 16.04 64位)中的项目,并且最近在使用工具>构建和重新加载构建软件包后开始出现错误.错误对话框显示:

Save File
No such file or directory 
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

构建和重新加载后,错误不会出现.相反,它发生在一段时间后,对文件进行编辑,似乎是随机的,而不是在尝试保存时.但是,关闭对话框文件后无法保存而不会生成其他错误,这次使用以下消息:

Error Saving File
No such file or directory 
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)

接下来,唯一的方法是重新启动RStudio而不保存任何文件,从而丢失所有更改.

它似乎不是roxygen2或devtools的问题,因为我尝试使用和不使用工具>项目选项>构建工具中的Roxygen使用devtools包函数选项生成文档.我也尝试卸载和重新安装RStudio以及更新devtools等,但问题仍然存在.我想知道它是否是其中一个包文件中的问题,例如NAMESPACE或DESCRIPTION.软件包存储库位于https://github.com/shaunpwilkinson/insect.

r devtools rstudio

7
推荐指数
1
解决办法
5264
查看次数

Chrome字体显示CSS属性

我最近一直在测试font-display,但我的Chrome浏览器(Chrome 65)在工作(Centos 7)和家用(Windows 10)似乎都不认为它是有效的属性.查看DevTools,该物业旁边有一个黄色感叹号,上面写着"未知物业名称".

font-display自63版以来,Chrome一直支持我的理解.

作为参考,我正在尝试设置的值font-displayswap.

任何人都有任何想法,为什么我没有看到它的工作?

谢谢

css devtools google-chrome-devtools

7
推荐指数
2
解决办法
2494
查看次数

什么是FireFox的monitorEvents()?

Google Chrome浏览器具有一项可以运行的功能,monitorEvents(document)并且您触发的每个事件都将记录在控制台中。

如何在FireFox中获得类似的功能?

我遇到了这个非常过时的答案,但是Firebug甚至不复存在:使用Firefox,我如何监视所有触发的JavaScript事件?

javascript firefox jquery google-chrome devtools

7
推荐指数
1
解决办法
1681
查看次数

R:检查检查目录中的非标准内容...注意找到以下文件/目录

这是我运行后收到的错误 devtools::check_rhub()

检查检查目录中的非标准内容...注意找到以下文件/目录:'disk.frame-Ex_i386.Rout''disk.frame-Ex_x64.Rout''examples_i386''examples_x64'

这些笔记在我跑步时不会出现devtools::check()

我不明白这些是什么意思。我正在运行的软件包是disk.frame

r devtools

7
推荐指数
1
解决办法
74
查看次数