当三列相同时删除行

Question

我有一个制表符分隔文件,我想删除仅在前三列中相同的行(保留一个副本).我更喜欢使用unix,例如awk或uniq.

输入文件:

Supercontig_1.1 241783  286397  5677    52
Supercontig_1.1 241783  286397  5678    53
Supercontig_1.1 241783  286397  5679    53
Supercontig_1.2 10500  25700  3000    57
Supercontig_1.2 10500  25700  3001    59
Supercontig_1.2 10500  25700  3002    59
Supercontig_1.3 2000  7000  5686    60
Supercontig_1.3 2000  7000  5687    60

输出:

 Supercontig_1.1 241783  286397  5677    52
 Supercontig_1.2 10500  25700  3000    57
 Supercontig_1.3 2000  7000  5686    60

Answer 1

一种方式使用awk:

awk '!array[$1,$2,$3]++' file.txt

结果:

Supercontig_1.1 241783 286397 5677 52
Supercontig_1.2 10500 25700 3000 57
Supercontig_1.3 2000 7000 5686 60