在多线程应用程序中使用 qsub (sge)

Question

我想向我正在使用的集群网络提交一个多线程作业 - 但关于 qsub 的手册页不清楚这是如何完成的 - 默认情况下，我想它只是将它作为正常作业发送，而不管多线程 -线程 - 但这可能会导致问题，即将许多多线程作业发送到同一台计算机，从而减慢速度。

有谁知道如何做到这一点？谢谢。

批处理服务器系统是 sge。

Answer 1

在 SGE/UGE 中，配置由管理员设置，因此您必须检查他们所谓的并行环境

qconf -spl 
make
our_paraq

$pe_slots在配置中寻找一个

qconf -sp make
qconf -sp our_paraq

qsub 具有该环境和您要使用的内核数

qsub -pe our_paraq 8 -cwd ./myscript

如果您使用的是 mpi，您有更多的配置分配规则（$pe_slots上面）选择，例如$round_robinand $fill_up，但这应该可以帮助您前进。