Rus*_*rdt 7 python serialization user-defined-functions apache-spark pyspark
如何避免在pyspark用户定义函数中初始化类?这是一个例子。
创建一个spark会话和代表四个纬度和经度的 DataFrame。
import pandas as pd
from pyspark import SparkConf
from pyspark.sql import SparkSession
conf = SparkConf()
conf.set('spark.sql.execution.arrow.pyspark.enabled', 'true')
spark = SparkSession.builder.config(conf=conf).getOrCreate()
sdf = spark.createDataFrame(pd.DataFrame({
'lat': [37, 42, 35, -22],
'lng': [-113, -107, 127, 34]}))
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这是 Spark 数据框
+---+----+
|lat| lng|
+---+----+
| 37|-113|
| 42|-107|
| 35| 127|
|-22| 34|
+---+----+
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通过包在每个纬度/经度处使用时区字符串丰富 DataFrame timezonefinder。 下面的代码运行没有错误
from typing import Iterator
from timezonefinder import TimezoneFinder
def func(iterator: Iterator[pd.DataFrame]) -> Iterator[pd.DataFrame]:
for dx in iterator:
tzf = TimezoneFinder()
dx['timezone'] = [tzf.timezone_at(lng=a, lat=b) for a, b in zip(dx['lng'], dx['lat'])]
yield dx
pdf = sdf.mapInPandas(func, schema='lat double, lng double, timezone string').toPandas()
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上面的代码运行没有错误,并创建了下面的 pandas DataFrame。问题是TimezoneFinder类是在用户定义的函数中初始化的,这会产生瓶颈
In [4]: pdf
Out[4]:
lat lng timezone
0 37.0 -113.0 America/Phoenix
1 42.0 -107.0 America/Denver
2 35.0 127.0 Asia/Seoul
3 -22.0 34.0 Africa/Maputo
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问题是如何让这段代码更像下面这样运行,其中TimezoneFinder类在用户定义的函数之外初始化一次。事实上,下面的代码会生成此错误PicklingError: Could not serialize object: TypeError: cannot pickle '_io.BufferedReader' object
def func(iterator: Iterator[pd.DataFrame]) -> Iterator[pd.DataFrame]:
for dx in iterator:
dx['timezone'] = [tzf.timezone_at(lng=a, lat=b) for a, b in zip(dx['lng'], dx['lat'])]
yield dx
tzf = TimezoneFinder()
pdf = sdf.mapInPandas(func, schema='lat double, lng double, timezone string').toPandas()
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更新 - 还尝试使用functools.partial外部函数,但仍然收到相同的错误。也就是说,这种方法不起作用:
def outer(iterator, tzf):
def func(iterator: Iterator[pd.DataFrame]) -> Iterator[pd.DataFrame]:
for dx in iterator:
dx['timezone'] = [tzf.timezone_at(lng=a, lat=b) for a, b in zip(dx['lng'], dx['lat'])]
yield dx
return func(iterator)
tzf = TimezoneFinder()
outer = partial(outer, tzf=tzf)
pdf = sdf.mapInPandas(outer, schema='lat double, lng double, timezone string').toPandas()
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您将需要每个工作线程上都有一个对象的缓存实例。你可以这样做
instance = [None]
def func(iterator: Iterator[pd.DataFrame]) -> Iterator[pd.DataFrame]:
if instance[0] is None:
instance[0] = TimezoneFinder()
tzf = instance[0]
for dx in iterator:
dx['timezone'] = [tzf.timezone_at(lng=a, lat=b) for a, b in zip(dx['lng'], dx['lat'])]
yield dx
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请注意,要实现此功能,您的函数将在模块内定义,以便为实例缓存提供存放的地方。否则,您将不得不将其挂在某些内置模块上,例如os.instance = [].
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