Preview v. Adob​​e 查看的 PDF 中带有 viridis 的颜色的奇怪外观

Question

我一直在使用heatmap.2()R创建热图。

我正在使用viridis()色标。

我曾经pdf()创建输出。

如您所见，在 OS X（版本 11.3.1）中使用 Adob​​e Acrobat（顶部面板）与使用预览（底部面板）查看 PDF 文件时，颜色键看起来不同。Adobe Acrobat 的外观更接近我的预期。预览中的颜色显得褪色和不饱和。

有没有其他人有这种经验？

原始帖子后添加的代码：

以下代码在热图中生成“褪色”颜色键：

library ('viridis')
library('gplots')
test.matrix <- matrix(ncol=25, nrow=9, -4:4)
breaks <- seq(-4,4,0.5)
pdf(file='heatmap.pdf', width=10, height=6)
heatmap.2(test.matrix, density.info = 'none',  trace='none', 
  Colv = F, Rowv = F, dendrogram = 'none', 
  col=viridis(length(breaks)-1), breaks=breaks 
          )
dev.off()

Answer 1

Adobe Reader（默认设置）不会完全按照文件中存储的方式显示绘图。您可以在“编辑”>“首选项”>“页面显示”中尝试设置。尝试使用其他 PDF 阅读器打开该文件，您可能会发现差异。Adobe 程序还可以使细线显得更粗、平滑低分辨率图像、填充附近线条之间的间隙等。