RStudio 发现 Python pyenv 安装，但我无法运行 Python 进程

Question

我正在尝试在 RStudio 中运行 Python。我已经通过 pyenv 安装了 Python 3.8.5，并在 RStudio 项目文件夹中使用 pyenv virtualenv （我称之为 venv-Rstudio）创建了一个虚拟环境。根据此处给出的说明，我认为我已正确地向 RStudio 指示要使用哪个 Python 环境：

>Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON="/Users/my_username/.pyenv/versions/venv-Rstudio/bin/python")
> py_discover_config()
python:         /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5/envs/venv-Rstudio/bin/python
libpython:      [NOT FOUND]
pythonhome:     /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5:/Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5
version:        3.8.5 (default, Oct  1 2020, 21:50:37)  [Clang 12.0.0 (clang-1200.0.32.2)]
numpy:          /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5/envs/venv-Rstudio/lib/python3.8/site-packages/numpy
numpy_version:  1.18.5

当尝试调用 Python 时，出现以下错误：

> py_config()
Error: Python shared library not found, Python bindings not loaded.
Use reticulate::install_miniconda() if you'd like to install a Miniconda Python environment.

我怀疑这与上面看到的有关libpython: [NOT FOUND]，但我已经确保 libpython 安装在 venv-Rstudio 虚拟环境中：

(venv-Rstudio) my_username@MBP15 Rstudio % pip list
Package                Version
---------------------- ---------
...
Keras                  2.4.3
Keras-Preprocessing    1.1.2
libpython              0.2
Markdown               3.2.2
multidict              4.7.6
numpy                  1.18.5
...

有什么想法我可能会错过以及如何解决这个问题吗？我正在运行 macOS 10.15.7 Catalina、RStudio 1.3 和 R 版本 4.0.2。

Answer 1

发布我的问题后，这个问题出现在相关列表中， @nucholab 的这个答案解决了我的问题。简而言之，使用以下命令通过 pyenv 重新安装 Python 即可启用可共享库：

env PYTHON_CONFIGURE_OPTS="--enable-shared" pyenv install 3.8.5 

之后，重新创建我的虚拟环境（并记录在案，安装 numpy），在 RStudio 中加载 Python 按预期工作：

> py_config()
python:         /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5/envs/venv-Rstudio/bin/python
libpython:      /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5/lib/libpython3.8.dylib
pythonhome:     /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5:/Users/andreas/.pyenv/versions/3.8.5
version:        3.8.5 (default, Oct  2 2020, 13:54:11)  [Clang 12.0.0 (clang-1200.0.32.2)]
numpy:          /Users/my_username/.pyenv/versions/3.8.5/envs/venv-Rstudio/lib/python3.8/site-packages/numpy
numpy_version:  1.19.2
tensorflow:     [NOT FOUND]

NOTE: Python version was forced by RETICULATE_PYTHON