And*_*eno 6 append rows pandas rolling-computation
我有一个相当大的数据集(大约 500 万行),其中有几个计算列,如滞后(1 和 7)和滚动窗口(7、30、90,每个都有几个值,如平均值、标准差、最小值、最大值等)。现在我需要向df添加一行或多行,我想知道(重新)计算这些特征的最有效方法。重新计算整个df会花费太多时间,但我不能简单地将函数应用于新添加的行。
对于滞后这不是一个大问题,我可以简单地,例如对于滞后 1,
df.iloc[-1, -2] = df.iloc[-2, -2]
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这应该可以解决问题(与滞后 7 相同),但是滚动窗口呢?同样的方法行不通,我无法在整个数据帧上(重新)运行滚动窗口。我要手工计算吗?还有其他办法吗?
Python 3.7.7 和 pandas 1.0.3
如果我正确地解释了这个问题,那么您有一个大型 DataFrame,其中包含一个或多个源数据列,然后是多个列,其中包含基于源列的窗口汇总统计信息。您尝试在将新行附加到源数据列后更新窗口摘要列的底部,而不重新计算整个摘要列。
解决此问题的方法取决于很多因素,包括您是否使用居中窗口。但希望这能让你开始。
我将从您的问题的玩具版本开始,具有单列source和两个窗口方式:
In [2]: df = pd.DataFrame({'source': np.arange(0, 20, 2)})
In [3]: for window in [3, 5]:
...: df[f'rolling_mean_{window}'] = (
...: df.source.rolling(window, center=True).mean())
...:
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然后我们在底部追加一个新行:
In [4]: df = df.append(pd.Series({'source': 100}), ignore_index=True)
In [5]: df
Out[5]:
source rolling_mean_3 rolling_mean_5
0 0.0 NaN NaN
1 2.0 2.0 NaN
2 4.0 4.0 4.0
3 6.0 6.0 6.0
4 8.0 8.0 8.0
5 10.0 10.0 10.0
6 12.0 12.0 12.0
7 14.0 14.0 14.0
8 16.0 16.0 NaN
9 18.0 NaN NaN
10 100.0 NaN NaN
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我们需要更新的数据量取决于窗口的长度。例如,为了更新rolling_mean_3,我们需要使用最后五行的信息来更新最后两行。为了安全起见,我们可以重新计算最后几2*window行加上您添加的行数:
In [6]: df.source.iloc[-(2*window+1):].rolling(window, center=True).mean()
Out[6]:
4 NaN
5 10.000000
6 12.000000
7 14.000000
8 16.000000
9 44.666667
10 NaN
Name: source, dtype: float64
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其中第 5-10 行的数据正确。请注意,第 4 行在此版本中不正确(现在是NaN),但我们可以使用此结果仅更新最后[-(window+1):]几行。这是完整的解决方案:
In [7]: updated_rows = 1
In [8]: for window in [3, 5]:
...: update_column_name = f'rolling_mean_{window}'
...: update_column_index = df.columns.get_loc(update_column_name)
...: df.iloc[-(window+updated_rows):, update_column_index] = (
...: df.source
...: .iloc[-(window*2+updated_rows):]
...: .rolling(window, center=True).mean()
...: .iloc[-(window+updated_rows):]
...: )
In [9]: df
Out[9]:
source rolling_mean_3 rolling_mean_5
0 0.0 NaN NaN
1 2.0 2.000000 NaN
2 4.0 4.000000 4.0
3 6.0 6.000000 6.0
4 8.0 8.000000 8.0
5 10.0 10.000000 10.0
6 12.0 12.000000 12.0
7 14.0 14.000000 14.0
8 16.0 16.000000 32.0
9 18.0 44.666667 NaN
10 100.0 NaN NaN
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现在已更新为具有正确计算的尾部。
从技术上讲,对于居中滚动操作,您只需要更新最后几行,从数据帧的floor(window/2)+updated_rows最后一行绘制。window+updated_rows所以你可以这样做来真正优化事情。
如果您生成不居中的滚动统计数据,则方法应该相同,但不包括居中标志。
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