knit/Rmarkdown/pandoc ：如何在 .Rmd 文件中全局设置参考书目路径

Question

[仅供参考：这个问题与 rmarkdown 有关：如何为文档使用多个参考书目

在 LaTeX 文档甚至 Rmarkdown 中.Rnw，我可以简单地使用类似的东西

\bibliography{graphics, statistics, timeref}

让 BibTeX 在我的本地目录下搜索文件graphics.bib、statistics.bib、 和。timeref.bibtexmf

在.Rmd使用yaml标题的文件中，我被迫使用绝对路径（不可移植）或相对路径（笨重、容易出错）列出每个参考书目文件。这是最近的一个例子：

---
title: "My Cool Paper"
author: "Me"
date: "`r format(Sys.time(), '%d %B, %Y')`"
output:
  html_document

bibliography:
  - "../../../localtexmf/bibtex/bib/graphics.bib"
  - "../../../localtexmf/bibtex/bib/statistics.bib"
  - "../../../localtexmf/bibtex/bib/timeref.bib"
---

问题：就像我可以r format(Sys.time(), '%d %B, %Y')使用 R 来填写日期一样，我可以使用一些 R 表达式来查找/填写 .bib 文件的路径吗bibliography:？

好的，从前面的问题来看，我尝试使用

bibliography:
  - "`r system('kpsewhich graphics.bib')`"
  - "`r system('kpsewhich statistics.bib')`"
  - "`r system('kpsewhich timeref.bib')`"

这会找到正确的路径，但只是将它们生成为 R markdown 日志中的输出，而不是生成到yaml标头中。我懂了：

processing file: Vis-MLM.Rmd
  |........                                                              |  11%
   inline R code fragments

C:/Users/friendly/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/graphics.bib
C:/Users/friendly/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/statistics.bib
C:/Users/friendly/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/timeref.bib

Answer 1

我差点就猜对了，但是忘了intern=TRUE

这有效：

bibliography:
  - "`r system('kpsewhich graphics.bib', intern=TRUE)`"
  - "`r system('kpsewhich statistics.bib', intern=TRUE)`"
  - "`r system('kpsewhich timeref.bib', intern=TRUE)`"