如何在 Jupyter Notebook 中运行 shell 脚本？

Question

所以我有一个 shell 脚本，它运行一个我将在Jupyter中使用的程序，但它是面向 bash 的，我尝试使用subprocess模块，然后我得到了error: OSError: [Errno 13] Permission denied. 但是，该脚本位于我的目录中，其中包含 ipynb 文件，因此我应该拥有权限。

import subprocess
subprocess.call(['./Heasoft.sh'])

这就是我所拥有的一切；它可以在终端中运行，但不能在笔记本中运行。我做错了什么吗？

Answer 1

您还可以通过在 jupyter 笔记本单元中输入来简单地运行任何脚本：

%%sh
cat myscript.sh 
./myscript.sh

Answer 2

chmod +x Heasoft.sh应该解决这个问题。如果没有，请添加#!/bin/bash到 shell 脚本的顶部。