将变量名列表作为参数传递给 R 函数

Question

我正在尝试实现以下目标：我有一个数据集，以及一个对该数据集进行子集化然后对子集执行一系列操作的函数。子集化是根据行名称进行的。我可以一步一步地执行此操作（即分别为每个子集运行此函数），但我有一个所需子集的列表，并且我想循环遍历此列表。听起来很复杂 - 请查看下面的示例。这就是我能做的：

#dataframe with rownames
whole_dataset <- data.frame(wt1 = c(1, 2, 3, 6, 6), 
                            wt2 = c(2, 3, 4, 4, 2))
row.names(whole_dataset) = c("HTA1", "HTA2", "HTB2", "CSE1", "CSE2")

# two different non-overlapping subsets
his <- c("HTA1", "HTA2", "HTB2")
cse <- c("CSE1", "CSE2")

#this is the function I have
fav_complex <- function (data, complex) {
  small_data<- data[complex,] #subset only the rows that you need 
  sum.all<-colSums(small_data) #calculate sum of columns
  return(sum.all)
}

#I generate two deparate named vectors
his_data <- fav_complex(data = whole_dataset, complex = his)
cse_data <- fav_complex(data = whole_dataset, complex = cse)

#and merge them
merged_data<- rbind(his_data,cse_data)

看起来像这样

> merged_data
         wt1 wt2
his_data   6   9
cse_data  12   6

我想以某种方式生成 merged_data 数据帧，而不必多次调用“fav_complex”函数。在现实生活中，我有大约 20 个子集，而且代码量很大。这是我的解决方案，不起作用

#I first have a character vector listing all the variable names
subset_list <- c("his", "cse")

#then create a loop that goes over this list

#make an empty dataframe
merged_data2 <- data.frame()

#fill it with a for loop output
for (element in subset_list) {
  result <- fav_complex(data = whole_dataset, element)
  merged_data2 <-rbind(merged_data2, result)
}

我知道这是错误的。在这个循环中，“element”只是一个字符串，而不是一个包含内容的变量。但我不知道如何使它成为一个变量。noquote(element) 不起作用。我尝试阅读有关非标准评估和 eval()、substitute() 的内容，但它对我来说太抽象了 - 我认为我的 R 专业知识还不够。

Answer 1

考虑by在所有子集中运行所需的操作。但首先创建一个组列：

# ANY FUNCTION TO APPLY ON SUBSETS (REMOVE GROUP COL)
fav_complex_new <- function (sub) {  
  sum.all <- colSums(transform(sub, group=NULL)) 
  return(sum.all)
}

# ASSIGN GROUPING
whole_dataset$group <- ifelse(row.names(whole_dataset) %in% his, "his",
                              ifelse(row.names(whole_dataset) %in% cse, "cse", NA))

# BY CALL
df_list <- by(whole_dataset, whole_dataset$group, FUN=fav_complex_new)
# COMBINE ALL DFs IN LIST
merged_data <- do.call(rbind, df_list)

Rextester demo （包括OP的原始及以上解决方案）