ree*_*dms 5 r ggplot2 geom-raster
我正在使用R求解具有R中两个变量的方程。我正在按序列更改两个变量,然后使用带有插值的geom_raster生成解图。
但是,在绘制数据时,我注意到绘制区域超出了我作为输入给出的y轴值的范围。
如果使用ylim对该区域施加限制,则插值图将缩小并且不再限制值。如果我使用vjust = 0,则图的顶部会限制该区域,而底部则不会。
我的可重现示例代码如下:
library(ggplot2)
library(reshape2)
x_range <- seq(0.001,10, by=0.001)
y_range <- (seq(1*10^-10, 1*10^-9, by = 1*10^-10))
FUN <- function(x, y) log10((1)/(x*y))
data <- outer(x_range, y_range, FUN)
colnames(data) <- y_range
rownames(data) <- x_range
melted_data <- melt(data)
p <- ggplot(data=melted_data)
# basic plot
p + geom_raster(aes(x=Var1, y=Var2, fill=value), interpolate = TRUE) +
geom_hline(yintercept = 1*10^-10) +
geom_hline(yintercept = 1*10^-9)
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# with imposed ylim
p + geom_raster(aes(x=Var1, y=Var2, fill=value), interpolate = TRUE) +
geom_hline(yintercept = 1*10^-10) +
geom_hline(yintercept = 1*10^-9) +
ylim(1*10^-9, 1*10^-10)
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# with modified vjust
p + geom_raster(aes(x=Var1, y=Var2, fill=value), interpolate = TRUE, vjust = 0) +
geom_hline(yintercept = 1*10^-10) +
geom_hline(yintercept = 1*10^-9)
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我希望最后的图约束给定的实际数据(由y = 1 * 10 ^ -9和y = 1 * 10 ^ -10的两条水平线指定。
我认为我正在观察的是由于插值的像素大小,但是我不确定。
我认为这与插值无关,并且与默认情况下geom_raster( 的特殊情况geom_tile)使用x/y作为每个图块的中心这一事实有关。指定vjust = 1会将图块向下移动,但想法仍然相同。您看到的超出限制的部分geom_hline是第一行图块的上半部分和最后一行图块的下半部分。
如果您不想显示这些半图块,您可以设置 y 轴限制而coord_cartesian不是ylim(这将限制应用于坐标系,而不是比例;请参阅?coord_cartesian更多详细信息)以放大到特定的数据范围:
p + geom_raster(aes(x=Var1, y=Var2, fill=value), interpolate = TRUE) +
# limit coordinate system, without expansion
coord_cartesian(ylim = c(1*10^-10, 1*10^-9), expand = FALSE)
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或者,如果您有其他几何图层超出c(1*10^-10, 1*10^-9)并且不想缩放,您可以添加一个遮罩图层来覆盖半图块:
p + geom_raster(aes(x=Var1, y=Var2, fill=value), interpolate = TRUE) +
# add masking layers
annotate(geom = "rect", xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = -Inf, ymax = 1*10^-10, fill = "white") +
annotate(geom = "rect", xmin = -Inf, xmax = Inf, ymin = 1*10^-9, ymax = Inf, fill = "white")
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