我在获取在 R Markdown 中工作的基本参考时遇到了很多麻烦。为了降低原始项目的复杂性,我决定使用 bookdown 示例代码,但我遇到了同样的问题。这是介绍示例代码的链接:https : //github.com/rstudio/bookdown-demo/blob/master/01-intro.Rmd
当我使用 Knitr 到 HTML 或 PDF 时,文件生成正常,但引用不起作用,而是文件只包含“@ref(example)”。这是一张可以更好地显示输出的图像(我的重点用红色添加):

图片直接链接:https : //i.imgur.com/2yxB5h3.png
这是一个最小的例子:
---
title: "Minimal"
output:
pdf_document:
fig_caption: yes
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
Here is a reference to the plot below \@ref(fig:minGraph)
```{r minGraph, echo=FALSE, fig.cap="\\label{fig:minGraph}test"}
plot(x=1)
```
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
输出如下所示:https : //i.imgur.com/J3UECqn.png
如果您想bookdown在普通rmarkdown文档中使用扩展名,您可以使用bookdown::html_document2andbookdown::pdf_document2代替rmarkdown::html_documentand rmarkdown::pdf_document。例子:
---
title: "Minimal"
output:
bookdown::html_document2:
fig_caption: yes
bookdown::pdf_document2:
fig_caption: yes
---
```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
Here is a reference to the plot below \@ref(fig:minGraph)
```{r minGraph, echo=FALSE, fig.cap="test"}
plot(x=1)
```
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)