R网状无法找到已安装的python库

Question

我正在尝试在R中使用Reticulate，psycopg2但在安装软件包时遇到了麻烦，但是我也尝试过twisted以相同的结果进行安装。

在我加载reticulateRI 之后，请仔细检查以确保安装了我的软件包：

> conda_install(envname = "r-reticulate", packages="psycopg2")
Solving environment: ...working... done

# All requested packages already installed.

看起来不错。因此，我将condaenv设置r-reticulate为可以肯定的一点。文档说我不必这样做，但它应该不会受到伤害：

> use_condaenv( "r-reticulate")

然后我尝试导入psycopg2：

> psycopg2 <- import('psycopg2')
Error in py_module_import(module, convert = convert) : 
  ImportError: No module named psycopg2

如果我twisted以相同的方式安装，则会收到相同的错误：

> twisted <- import('twisted')
Error in py_module_import(module, convert = convert) : 
  ImportError: No module named twisted

那么，我在这里做错了什么？

以下是conda_listand 的输出py_config。。。我期望py_config向我展示r-reticulate环境中python exe的路径。但是，我没有什么可与之相比，因此我的期望可能是错误的。

> conda_list()
          name                                                                              python
1     Anaconda                     C:\\Users\\jal\\AppData\\Local\\Continuum\\Anaconda\\python.exe
2 r-reticulate C:\\Users\\jal\\AppData\\Local\\Continuum\\Anaconda\\envs\\r-reticulate\\python.exe

> py_config()
python:         C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
libpython:      C:/Users/jal/AppData/Local/CONTIN~1/Anaconda/python27.dll
pythonhome:     C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda
version:        2.7.15 |Anaconda custom (64-bit)| (default, May  1 2018, 18:37:09) [MSC v.1500 64 bit (AMD64)]
Architecture:   64bit
numpy:          C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\lib\site-packages\numpy
numpy_version:  1.14.3
pandas:         C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\lib\site-packages\pandas

python versions found: 
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\ANACON~1\python.exe

Answer 1

我一时兴起下载并安装了最新的RStudio桌面（1.2.701），并从1.1.442升级。这似乎已经解决了我的问题。程序包加载后，我现在看到，在运行时，py_config我看到的路径反映了我所选择的环境。

> py_config()
python:         C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe
libpython:      C:/Users/jal/AppData/Local/Continuum/Anaconda/envs/r-reticulate/python36.dll
pythonhome:     C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1
version:        3.6.5 |Anaconda, Inc.| (default, Mar 29 2018, 13:32:41) [MSC v.1900 64 bit (AMD64)]
Architecture:   64bit
numpy:          C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1\lib\site-packages\numpy
numpy_version:  1.14.3
psycopg2:       C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\envs\R-RETI~1\lib\site-packages\psycopg2

python versions found: 
 C:\Users\jal\AppData\Local\Continuum\Anaconda\envs\r-reticulate\python.exe
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\Anaconda\python.exe
 C:\Users\jal\AppData\Local\CONTIN~1\ANACON~1\python.exe