phy*_*pho 3 python scikit-learn joblib python-3.6
由于我从 python3.5 移动到 3.6,使用 joblib 的并行计算并没有减少计算时间。以下是安装的库版本:-python:3.6.3-joblib:0.11-numpy:1.14.0
基于一个非常著名的例子,我在下面给出了一个示例代码来重现这个问题:
import time
import numpy as np
from joblib import Parallel, delayed
def square_int(i):
return i * i
ndata = 1000000
ti = time.time()
results = []
for i in range(ndata):
results.append(square_int(i))
duration = np.round(time.time() - ti,4)
print(f"standard computation: {duration} s" )
for njobs in [1,2,3,4] :
ti = time.time()
results = []
results = Parallel(n_jobs=njobs, backend="multiprocessing")\
(delayed(square_int)(i) for i in range(ndata))
duration = np.round(time.time() - ti,4)
print(f"{njobs} jobs computation: {duration} s" )
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
我得到以下输出:
当我将 ndata 的数量增加 10 倍并删除 1 个核心计算时,我得到了这些结果:
有没有人知道我应该调查哪个方向?
我认为主要原因是并行的开销超过了好处。换句话说,您square_int太简单了,无法通过并行获得任何性能改进。这square_int很简单,在进程之间传递输入和输出可能比执行函数花费更多的时间square_int。
我通过创建一个square_int_batch函数修改了你的代码。它大大减少了计算时间,尽管它仍然比串行实现要多。
import time
import numpy as np
from joblib import Parallel, delayed
def square_int(i):
return i * i
def square_int_batch(a,b):
results=[]
for i in range(a,b):
results.append(square_int(i))
return results
ndata = 1000000
ti = time.time()
results = []
for i in range(ndata):
results.append(square_int(i))
# results = [square_int(i) for i in range(ndata)]
duration = np.round(time.time() - ti,4)
print(f"standard computation: {duration} s" )
batch_num = 3
batch_size=int(ndata/batch_num)
for njobs in [2,3,4] :
ti = time.time()
results = []
a = list(range(ndata))
# results = Parallel(n_jobs=njobs, )(delayed(square_int)(i) for i in range(ndata))
# results = Parallel(n_jobs=njobs, backend="multiprocessing")(delayed(
results = Parallel(n_jobs=njobs)(delayed(
square_int_batch)(i*batch_size,(i+1)*batch_size) for i in range(batch_num))
duration = np.round(time.time() - ti,4)
print(f"{njobs} jobs computation: {duration} s" )
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
计算时间是
standard computation: 0.3184 s
2 jobs computation: 0.5079 s
3 jobs computation: 0.6466 s
4 jobs computation: 0.4836 s
Run Code Online (Sandbox Code Playgroud)
其他一些有助于减少时间的建议。
results = [square_int(i) for i in range(ndata)]在您的特定情况下使用列表理解替换 for 循环,它更快。我测试过。batch_num为合理的大小。该值越大,开销越大。batch_num在我的情况下,当超过 1000时,它开始变得明显变慢。loky而不是multiprocessing. 它稍微快一点,至少在我的情况下。从其他一些 SO 问题中,我了解到多处理适用于CPU 密集型任务,对此我没有官方定义。你可以自己探索一下。
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