Sil*_*via 2 r normal-distribution poisson model-fitting data-fitting
我有一个包含 1096 个数字的向量,这是一个测量站 3 年内测量的 NOx 的日平均浓度。您可以观察图像中的分布类型:

我使用这些命令来做直方图:
NOxV<-scan("NOx_Vt15-17.txt")
hist.NOxVt<-hist(NOxV, plot = FALSE, breaks = 24)
plot(hist.NOxVt, xlab = "[NOx]", ylab = "Frequenze assolute", main = "Istogramma freq. ass. NOx 15-17 Viterbo")
points(hist.NOxVt$mids, hist.NOxVt$counts, col= "red")
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我的教授建议我用泊松分布拟合直方图 - 注意转换:离散 -> 连续(我不知道这意味着什么) - 或“对数正态”分布。
我尝试使用她在课程中给我们的一些命令行来进行泊松拟合,但是在执行以下最后一行代码后,R 给了我一个错误:
my_poisson = function(params, x){
exp(-params)*params^x/factorial(x)
}
y<-hist.NOxVt$counts/1096;
x<-hist.NOxVt$mids;
z <- nls( y ~ exp(-a)*a^x/factorial(x), start=list(a=1) )
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numericDeriv(form[[3L]], names(ind), env) 中的错误:评估模型时产生的缺失值或无穷大此外:有 50 个或更多警告(使用警告()查看前 50 个)”
这个问题解决不了(在网上搜索类似问题)我决定用对数正态拟合分布,但我不知道怎么做,因为教授没有给我们解释,我仍然没有足够的 R 经验来自己解决。
我将不胜感激有关如何进行对数正态拟合和/或泊松拟合的任何建议或示例。
R 附带fitdistr的MASS包中有一个内置函数:
生成要查看的数据示例(注视参数以获得与您的图片类似的内容):
set.seed(101)
z <- rlnorm(1096,meanlog=4.5,sdlog=0.8)
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拟合(基于统计,我不推荐泊松拟合 - 可能可以采用离散分布,如泊松(或更好的负二项式)来拟合这样的连续数据,但对数正态分布或伽玛分布是更自然的选择.
library(MASS)
f1 <- fitdistr(z,"lognormal")
f2 <- fitdistr(z,"Gamma")
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的f1和f2的目的,在打印时,得到的估计系数(meanlog和sdlog为对数正态,shape和rate用于伽马)和系数的标准误差。
画一张图(在密度标度上,而不是计数标度上):红色是对数正态,蓝色是伽玛(在这种情况下,对数正态更适合,因为这就是我首先生成“数据”的方式)。[该with(as.list(coef(...))东西是一些ř装饰性,以允许使用的名称的系数(的meanlog,sdlog在随后的R代码等)。]
hist(z,col="gray",breaks=50,freq=FALSE)
with(as.list(coef(f1)),
curve(dlnorm(x,meanlog,sdlog),
add=TRUE,col="red",lwd=2))
with(as.list(coef(f2)),
curve(dgamma(x,shape=shape,rate=rate),
add=TRUE,col="blue",lwd=2))
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