将 numpy 数组转换为 Matrix rpy2, Kmeans

Question

我有一个 numpy 二维数组 self.sub，我想在 rpy2 kmeans 中使用它。k = robjects.r.kmeans(self.sub,2,20) 我总是收到以下错误：valueError：目前对该类型无能为力！我能做什么？

Answer 1

从 rpy2文档中，R 矩阵只是带有暗属性集的向量。所以对于一个 numpy 二维数组 x

import rpy2.robjects as robj

nr, nc = x.shape
xvec = robj.FloatVector(x.transpose().reshape((x.size))
xr = robj.r.matrix(xvec, nrow=nr, ncol=nc)

您必须转置 numpy 数组，因为 R 按列填充矩阵。

编辑：实际上，您可以在 R 矩阵函数中设置 byrow=True ，然后您就不需要转置了。