GNU Parallel中的基本名称

Question

我有数百个文件，命名如下：

RG1-t.txt

RG1-n.txt

RG2-t.txt

RG2-n.txt

等等...

我想使用GNU并行在它们上运行脚本，但是我很难获取文件的基本名称，因此RG1，RG2等...这样我就可以运行：

ls RG*.txt | parallel "command.sh {basename}-t.txt {basename}-n.txt > {basename}.out"

导致文件RG1.out，RG2.out等。有什么想法吗？

Answer 1

使用内置的剥离选项：

6. Dirname（{/}）和basename（{%}）并删除自定义后缀（{^suffix}）

   $ echo dir/file_1.txt.gz | parallel --plus echo {//} {/} {%_1.txt.gz}

7. 获取基本名称，并删除last（{.}）或任何（{:}）扩展名

   $ echo dir.d/file.txt.gz | parallel 'echo {.} {:} {/.} {/:}'

这应该可以满足您的需求：

ls RG*.txt | parallel "command.sh {.}-t.txt {.}-n.txt > {.}.out"

Answer 2

尝试parallel这样喂食：

ls RG*t.txt | cut -d'-' -f1 | parallel 'command.sh {}-t.txt {}-n.txt > {}.out'

或者，如果您愿意awk：

ls RG*t.txt | awk -F'-' '{print $1}' | parallel ...

或者，如果您愿意sed：

ls RG*t.txt | sed 's/-.*//' | parallel ...

或者，如果您更喜欢 GNU grep：

ls RG* | grep -Po '.*(?=-t.txt)' | parallel ...