什么是snakemake元数据文件？我什么时候可以删除？

Question

我注意到我的备份rsync脚本花了很多时间从.snakemake/metadata文件夹中复制具有随机名称的内容。

这些文件是用来做什么的？

我可以在完成蛇形运行之后安全地擦除它们吗，或者它们是蛇形正确执行下一次运行所必需的吗？

更一般而言，是否有一些有关蛇形.snakemake文件夹中创建的文件的文档？

Answer 1

根据Snakemake的创建者Johannes Koster的评论：

[.snakemake /目录]用于跟踪（a）每个文件的version关键字的值，（b）每个文件的规则实现，以便在用-调用snakemake时通知用户是否发生了更改。 -摘要。

来自Google网上论坛的相关评论：

通常，如果没有正在运行的Snakemake实例，并且您确定所有现有输出文件都完整，则可以删除整个.snakemake目录。它仅包含数据来源信息（例如，跟踪代码输入文件或参数更改[ 以确定是否应重新运行工作流 ]）。您可能想要保留.snakemake / conda，因为它包含工作流中使用的conda环境。

编辑：要.snakemake/在成功执行管道后自动删除目录，onssuccess可以使用该钩子：

import shutil
onsuccess:
    shutil.rmtree(".snakemake")